前中研院院長李遠哲說，「當年清大首次遴選校長，我幫清大選出國外一流大學的教授來當校長，今天的台大沒有能力」，意指台大遴選出的校長當選人管中閔不如清大首任遴選校長。 

清大首任遴選校長是沈君山，但他未在國外任教，第二任則是劉炯朗，兩任都有李遠哲參與。以劉炯朗來說，他是哪一個「國外一流大學」的教授？美國伊利諾大學香檳分校，他在該校的資訊工程系當了多年教授，後來升任副校長，在一九九八年回到台灣擔任清大校長。 

至於不被李遠哲看在眼裡的台大校長當選人管中閔，他在回到台大任教前，剛好也在伊利諾大學香檳分校經濟系任教，並獲得傑出教師獎，後來升到了副教授。如果他當時留在美國，繼續在伊利諾大學任教，升遷之路必定是一片坦途，但他選擇回到台灣。此外，劉炯朗在二○○○年當選中研院院士，當時已六十六歲，而管中閔在二○○二年當選中研院院士，當時才四十六歲。 

這樣說來，管中閔的學術成就與聲望會輸給李遠哲中意的人選嗎？李遠哲到底有沒有把管中閔的背景弄清楚？ 

不管是不是國外名校的教授，能把台大帶向進步之路就是好校長，而以今天台大的辦學困境來說，財務是最大問題。李遠哲的母校美國加州柏克萊大學，一年辦學經費達六百多億台幣，是台大的四倍，光是私人捐助與附屬企業收入就高達百億台幣，而管中閔因為有財經背景，並且在遴選過程裡，對於如何改善台大財務也提出最為宏觀可行的辦法，或許因而得到遴選委員會青睞。 

管中閔都還沒上任，李遠哲怎麼知道他不是一流校長？