1685年的” 議會”是絕對的保皇黨，授予國王關稅收入過著舒適生活，以緊急軍事援助遏止詹姆斯斯科特·蒙茅斯公爵(James Scott, duke of Monmouth)的叛亂。

1685年7月6日，查理斯二世非婚生兒子詹姆斯斯科特·蒙茅斯公爵發動的叛亂，在塞奇莫爾戰役(the Battle of Sedgemoor)被徹底擊敗-----這應可視為1683年拉伊豪斯陰謀( the Rye House Plot)的後續。   8月26日的血腥巡迴審判(the Bloody Assizes)，包括詹姆斯斯科特·蒙茅斯公爵及超過444名被吊死或被拖行到行刑地點、吊死並支解為四塊(hanged, drawn and quartered.)，超過850名的追隨者以契約奴工送往西印度群島，這是非常殘酷的鎮壓!!

英格蘭政府看上去已回歸常態”議會”，君主政體中國王實質的相關權力也增強了。 詹姆斯二世誤解蒙茅斯公爵的失敗即意味著合法繼承將高於國家的一切。  叛亂期間，國王已清楚表明他打算維持大規模的常備軍隊(standing army)，廢除測試法案(Test Act)並任命天主教徒為軍事指揮官-----這導致與”議會”的對抗，1685年11月宣佈休會。   

1685年10月18日，法蘭西路易十四又宣佈撤銷了南特敕令(the Edict of Nantes) ，鎮壓胡格諾派(the Huguenots)的舉動的激怒了英格蘭公眾輿論。  此後幾年內導致四十萬胡格諾派(the Huguenots)教徒陸續遷移到英格蘭、普魯士、荷蘭及北美洲，使法蘭西失去大量勤奮的工商業群體。    詹姆斯二世在倫敦接見教廷大使(the papal nuncio)，這是自瑪麗一世後一百多年來的第一次教宗代表來到英格蘭。

在17世紀，天主教和君主專制主義聯繫在一起，英格蘭一般人對於天主教大多沒有好感------一方面是印刷術的成熟導致報紙行業的發展，大眾媒體宣染三十年戰爭的暴行而同情歐洲新教徒的處境，另一方面是源於信仰羅馬天主教的英格蘭瑪麗一世(Mary I of England)於1553年~1558年在位期間，以異端罪名至少燒死了287名新教徒的事實。   因此，國王出面維護天主教徒的努力從一開始就註定會失敗。

此外，他努力推動不信奉國教聯盟被證明是不成功的。  當詹姆斯二世 向威廉 · 佩恩(William Penn)和貴格派(the Quakers)示好----1687 他重新發佈寬容宣言(the Declaration of Indulgence)暫停對天主教徒和非聖公會教徒(Dissenters)的刑事法律;這是一項臨時措施，因為詹姆斯希望他下一屆的”議會”完整的廢除刑法典 。  他最主要的英格蘭聖公會部長，亨利海德·克拉倫登伯爵(Henry Hyde, earl of Clarendon)和勞倫斯海德·羅徹斯特伯爵 (Lawrence Hyde, earl of Rochester)選擇辭職。

1688年，當他試圖對天主教徒開放大學時，遇到強烈的反對，他強制任命了牛津大學莫德林學院(Magdalen College, Oxford)天主教的領導，導致與學校評議委員間的公開決裂。  

保皇黨(Tories)是堅定的支持英格蘭教會和國王的利益組合；詹姆斯二世錯誤的相信，他們會在捨棄了英格蘭教會的情況下支持國王。  以上的各種措施使國王與英格蘭教會的支持者處於衝突的軌道上。

兩個相關的事件爆發了詹姆斯二世 統治的最終危機。

1688年4月，包括坎特伯雷大主教(the Archbishop of Canterbury)在內的七位主教拒絕指示其教區的牧師，在他們的教堂中宣讀寬容宣言(the Declaration of Indulgence)。  國王被這意想不到阻擾他的計畫的行動激怒了，他囚禁並指控這些主教煽動、誹謗罪，進行審訊。當主教們被倫敦陪審團宣告無罪時，政府內所有政治團體的領導人意識到，是將在1667年4月就開始的密謀付諸行動的時刻了。

1688年6 月，瑪麗皇后(Mary of Modena) 生了男性繼承人，確定了詹姆斯二世會有信仰天主教的繼承人，也改變了英格蘭王位繼承的順位。   荷蘭聯合共和國(the Republic of the Seven United Provinces)的”當值領導”( the stadtholder) 威廉親王三世·奧蘭治親王(William III, Prince of Orange)害怕未來可能導致英法天主教聯盟的威脅。        

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