據民間傳說，城隍爺不是固定的某一位神明，而是由玉皇大帝指派生前忠孝良悌或對地方有功先賢，往生後「升格」成為當地的城隍爺，成為地方的守護神。
 而城隍爺的地位如同地方的行政首長，掌管地方內的大小事務，各地源起與造型不一，但大致上都頭戴官帽、留長髯的文官扮相，而城隍爺不僅是護國祐民之地方神，也是賞罰分明的司法神，能「司陰陽，察善惡，辨是非，定功過」，所以配有司文及武判官。

                   小南城隍廟                      二城隍朱一貴

因此，相傳地方官若碰到棘手懸案，就會到城隍廟內請求「神判」，以求破案的契機，所以在明清之後，規定在各地官署附近都必須建有城隍廟，當時城隍廟為官廟，地方父母官新上任，要先到城隍廟舉行奉告典禮才赴任就職，所以全台至少有近百間的城隍廟。但現在城隍廟已相當平民化，常是信徒香客祈求平安或求功名的廟宇。

          大城隍公杜昭儀、二城隍公朱一貴、三城隍公雷域輝

但台灣城隍廟雖然數量眾多，但每座城隍廟興建的原因與城隍爺的來源卻都不盡相同，除了上述明清時期官祀的城隍廟外，如：台南於明永曆二十三年(1669年)所建的『台灣府城隍廟』、高雄於清康熙五十七年(1718年)所建的『鳳山縣城隍廟』，又稱『舊城城隍廟』等等。還有由先民從故鄉分靈帶來的城隍爺，橫渡台灣海峽來到了台灣後，為了感謝家鄉神明的庇護，於是再立廟祭祀的，如：台北大稻埕的『霞海城隍廟』（福建省同安縣霞海城隍廟）、『竹山靈德廟』（福建省福州城隍廟）等等，而民國以後建立的城隍廟，大部份都是再從這些廟分靈出去的。  另外，民間也有萬應公或大眾爺等升格的城隍爺，如：台南市的小北城隍廟裡的城隍爺，就是由萬應公升格而來的。或像是嘉義朴子城隍宮的城隍爺，是溪水暴漲時漂來的神像而建廟。   但最特殊的，莫過於位於台南市開山路上的『小南城隍廟』內的城隍爺了。該廟主祀大城隍公杜昭儀、二城隍公朱一貴、三城隍公雷域輝。其中二城隍公俗稱『小城隍』，也就是民間所說的「鴨母王」朱一貴。                              

                         鴨母王朱一貴

 朱一貴，原名祖，生於清康熙二十八年（西元1689年），卒於康熙六十年（西元1721年）。原籍漳州長泰，後渡台移居於羅漢門（今高雄縣(註 1)內門鄉(註 2)）鴨母寮，養鴨為業。性任俠好客，往來多為故國遺民、草澤壯士與奇僧劍客，常宰鴨煮酒談論時政。
 清康熙六十年三月，由於清廷鳳山縣令稅斂苛刻，人稱「鴨母王」的朱一貴謀起兵，自稱朱明後裔，率領明鄭遺臣與粵庄杜君英等抗清志士共同起義，在短短七日之內從羅漢門一路打進府城，攻陷府城後自立為王，但最後反清復明的壯舉因閩粵分裂內訌，在短短一個月之後宣告失敗，朱一貴最後敗走溝尾莊（嘉義縣大保市後庄）被擒，押送北京束手就義。
據民間傳說，玉皇上帝對鴨母王朱一貴慷慨赴義的精神十分感佩，所以封為「台南州城隍綏靖侯」，俗稱『小城隍』。

           大城隍公杜昭儀

                  三城隍公雷域輝

同治年間，後人以石頭砌成小祠堂，祭祀當年抗清的明朝遺臣義士，並以小城隍爺朱一貴為主祀。光緒年間信士方馬德、方李親夫婦，從台南縣(註 3)安定海寮前往府城探親，後定居於府城小南門附近，與小城隍爺結緣並成為虔誠信徒，在民國初年獨力重修廟貌。民國七十二年因為政府拓寬開山路，舊廟遭拆除，小城隍爺金身移奉至現今廟址，並由方馬德之女吳方愛珠籌資重建，新廟直到民國八十三年才告落成。而「鴨母王」朱一貴被小南城隍廟 信眾奉為主神，至今已有百餘年。每年農曆六月十六日大城隍壽誕、農曆八月十日二城隍壽誕、農曆六月二十二日三城隍以及農曆十月十日為該廟建醮，均有慶典。