月經來時會疼痛（痛經），可以分為原發性及次發性。

原發性痛經是沒有病理性原因的。很多女性在月經來時會在第一天或第二天（也就是量多之時），覺得特別別疼痛，但一旦量少之後，便不再覺得痛，或是可以忍受。而往往在生過小孩之後，痛經便消失了。這是生理性痛經或原發性痛經的特徵。

原發性痛經不會影響懷孕。

而次發性痛經，則是由其他病理性的原因造成的話，對懷孕的影響，則和造成痛經的原因有關。如果痛經是因為慢性骨盆腔炎（很多人以為慢性骨盆腔炎和痛經無關，其實是有關）而沒有造成輸管阻塞或膿瘍時，治療好之後並不會影響懷孕；但如子宮內膜異位症，甚至造成沾黏了（這可能是最常見的原因），那倒是會造成不孕。

因此如果痛經的話，先別恐慌，別因為痛經就以為是子宮內膜異位症。而如果真的有子宮內膜異位症，早期治療，術後儘早懷孕，不僅可以保住日後再懷孕的能力，同時也可以減少子宮內膜異位症復發的機率！