俄國援助國民黨的目的是為了讓中國與英美日為敵，這三國就是帝國主義的代名詞。為防止蔣介石走向反面，共產黨教唆國民革命軍第二軍、第六軍在南京搶劫、殺害外國僑民及外交官，李富春、林伯渠是主要的策劃人。

由於日本政府命令軍方不得對中國軍隊開火，在南京的日本海軍陸戰隊少尉荒木覺得有虧護僑之責而自殺；

1927年8月，蔣介石因被黨內多數派系指控為專制軍閥而下野；蔣介石隨後赴日，在討論宋美齡的婚事同時，拜訪了日本政要。日本方面希望國民黨與張作霖實現南北分治，停止北伐；蔣介石表示尊重日本在東北的特權，但關內一定要統一。

1928年1月，蔣介石在汪精衛、馮玉祥、閻錫山等派系的支持下而復出，隨後展開二次北伐；

為阻止國民革命軍北上，1928年5月，日本派出福田彥助第六師團附海軍陸戰隊開赴濟南，與國軍接戰，釀成「濟南事變」。馮玉祥、白崇禧、方振武等多數高級將領認為應當與日本開戰，蔣介石、閻錫山則主張屈服，撤離濟南，繞道北伐。

由於張作霖對於日軍進駐山東，公開發表抗議，認為日本侵犯中國主權，以及其他種種舉動，關東軍司令官村岡長太郎、高級參謀河本大作大佐、奉軍日方軍事顧問土肥原賢二等遂合謀，于6月4日將張作霖炸死于沈陽西北之皇姑屯。

濟南事件及張作霖被炸，令中國的反日情緒空前高漲，使得裕仁天皇對首相田中義一極度不滿也不再信任，這最終導致田中義一內閣總辭職；但謀殺張作霖的元兇村岡長太郎、河本大作等人則僅僅轉為預備役而草草了事。這導致關東軍日後愈發膽大妄為。

張作霖之子張學良不久宣佈擁護南京國民政府，日本企圖令東三省獨立之計劃化為泡影。

1929年2月，國民黨的實力派人物李宗仁、白崇禧、黃紹竑、馮玉祥、唐生智、張發奎、閻錫山等紛紛反蔣，政治上以汪精衛為領袖，掀起血腥內戰。

1929年1月，張學良殺死了不服從其領導的楊宇霆、常蔭槐，造成東北人心動蕩；為樹立權威，張學良決心在日俄兩國中選擇其一，將其勢力驅逐出中國。張學良誤判蘇俄不敢與中國大規模開戰，遂於1929年7月，實施驅逐俄人，收回中東路主權的行動。蔣介石此前表示將全力支持張學良此一行動。

7月18日，俄國宣佈與中國斷交；

8月，俄國海陸空三軍4萬餘人入侵中國，東北軍連戰連敗，張學良向蔣介石求援；但此時蔣介石忙於與馮玉祥、李宗仁、張發奎等的內戰，無暇顧及東北。

1929年12月，張學良與俄國達成《伯力協定》，恢復俄國在中國東北的所有特權。

中東路戰爭，令日本了解了俄國目前的軍事實力，亦了解了東北軍的戰鬥力。

中東路事件中，中國共產黨公開支持俄國；而呼籲放棄黨派之爭，共同捍衛中華民族主權的陳獨秀被中共開除黨籍。

1929年11月29日，主張日中和解的日本駐華公使佐分利貞男被刺殺于箱根，中日兩國互指對方為兇手，真相至今未明。