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花蓮舊站
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明治43年（1910）12月16日：花蓮港驛開始營業，同日花蓮港至鯉魚尾鐵路通車。
明治44年（1911）2月17日：花蓮港驛舍完工。
昭和6年（1931）：原木造站房因不敷使用，改建為水泥磚造站房。
昭和14年（1939）9月20日：花蓮港至東花蓮港驛間鐵路完成，東花蓮港驛開始營業。昭和16年（1941）4月19日裁撤花蓮港海岸驛，這段長1.1公里的路線保留到民國71年（1982）東拓完工時才拆除。
民國38年（1949）4月4日：建於日治時期之站房不敷使用，動工擴建。
民國38年（1949）6月24日：站房完工啟用，擴建後站房一樓部分維持原狀，二樓部分予以加高。
民國40年（1951）1月15日：花蓮港站改稱為花蓮站，同日東花蓮港站改稱花蓮港站。
民國69年（1980）2月花蓮舊火車站遷移到新站。
民國71年（1982）6月27日東線全線拓寬完成，花蓮舊站因車站業務遷移至花蓮新站辦理而裁撤停用，保留一個售票窗口代售花蓮新站車票，直至民國77年（1988）才停辦，同年7月1日花蓮新站改名為花蓮站。
民國81年（1992）9月花蓮舊火車站拆除。
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田浦
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明治43年（1910）12月16日，設立荳蘭驛，開始營業。
昭和12年（1937）11月1日，隨地名改稱為田浦驛。田浦，此地盛產胡頹子樹，結實如豆，阿美族人稱此豆為「太奧魯」，漢人譯作「荳蘭」。
東線拓寬時計劃將吉安舊站及田浦兩站合併為一站，由於與吉安新站距離僅1公里，後決定裁撤田浦站。
民國71年（1982）6月26日，東線拓寬工程完工通車，同日田浦站正式裁撤。裁撤後站房並未立即拆除，後來因遭颱風吹倒後才拆除。
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干城
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大正5年（1916）11月1日：設初音停車場。
民國36年（1947）10月6日：改稱初英停車場。
民國49年（1960）7月1日：配合當地地名，改稱南華車站。
民國78年（1989）3月1日：因行政區屬吉安鄉干城村，站名配合村名改為干城車站。
民國83年（1994）4月1日：廢站。
本站在日治伐木業興盛時以輸運木材為大宗，中華紙漿廠設廠後，有專用側線從干城站通往中華紙漿廠，運輸紙漿原料。
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溪口
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明治44年（1911）7月15日：溪口驛開業，站址在現溪口社區臺9線西側，為折返式車站。
民國68年（1979）：東拓工程新建車站東移至溪口河底隧道北口。
民國71年（1982）3月31日：車站南邊溪口河底隧道完工通車。
民國75年（1986）3月24日：降為招呼站。
民國102年（2013）11月14日：因新溪口河底隧道改線，停止辦理客運，因而廢站。
民國104年（2015）1月：站場填平，站體拆除。
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林榮舊站
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大正7年（1918）11月1日：設平林停車場（於林榮里55號）。
民國51年（1962）12月15日：站名改為林榮。
民國71年（1982）3月31日：廢站。東拓時線路截彎取直，新建溪口河底隧道，線路遠離聚落且為地下化，舊林榮車站因而廢站。
民國77年（1988）：林榮車站主體拆除，僅剩下倉庫與宿舍，原址改建成林榮公園。
民國107年（2018）7月10日：新光林榮車站於兆豐路800號復站。
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大興
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民國49年（1960）：啟用。
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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瑞北
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民國45年（1956）：因應居民需要於富源至瑞穗間增設瑞北站，當時為招呼站，此地位因於瑞穗之北方故稱「瑞北」。
民國60年（1971）6月1日：降為簡易站。
民國61年（1972）7月1日：降為招呼站，由瑞穗站管理。
民國92年（2003）8月23日：富源至瑞穗間路線進行截彎取直工程改線並高架化，新路線從瑞北站上方通過，路線切換完成後瑞北站裁撤。
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舞鶴號誌
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民國45年（1956）：設立舞鶴車站，招呼站。
民國46年（1957）12月1日：改為三等站。
民國60年（1971）6月1日：降為簡易站。
民國61年（1972）7月1日：改為招呼站。
民國71年（1982）：東線鐵路拓寬，車站重建完成但並未設站營業。
民國94年（2005）9月30日：設立號誌站。拆除原本廢棄的月臺，另鋪上一股道。
民國106年（2017）9月26日：切換至新自強隧道新線，正式裁撤。
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大禹
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大正6年（1917）11月1日：設末廣驛，「末広」日文念作すえひろ（suehiro）。此地原名針塱，日治時期鐵路開通將針塱改名為末廣。
民國35年（1946）：臺灣光復後當地居民認為末廣地名不雅，改為光復里，又與光復鄉地名相同，後選擇以「大禹治水」改為玉里鎮大禹里，站名配合地名改為大禹。
民國84年（1995）3月1日：裁撤，廢站後玉里站到三民站距長達11.5公里，成為花東線鐵路最長站間里程。
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泰昌
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民國59年（1970）11月15日：為便利旅客乘車，於大禹站至玉里站間增設泰昌招呼站，由玉里站管理，泰昌招呼站規模很小，整個車站只設有一個水泥磚造候車亭。
民國71年（1882）6月27日：因旅客人數稀少且與玉里站間距離甚近，東拓後裁撤泰昌站，水泥磚造候車亭被留存一段時間，於民國94年（2005）左右拆除。
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樂合
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民國46年（1957）：設站。
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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安通
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大正13年（1924）4月27日：設立安通乘降場，5月1日改為安通驛。
昭和4年（1929）：遷至現址。
民國75年（1986）4月24日：降等為招呼站。
民國96年（2007）3月30日：玉里至東里截彎取直完成後本站裁撤，站房仍存。
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萬寧
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民國46（1957）：啟用。
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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富北
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民國46年（1957）：啟用。
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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富南
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民國48年（1959）：啟用。
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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三台
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民國50年（1961）11月：設立三台招呼站
民國71年（1982）：東拓完工時裁撤。
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德高
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民國45年（1956）11月15日：為便利旅客乘車，於海端站至關山站間增設德高招呼站，由關山站管理，德高招呼站規模很小，只有一座水泥磚造候車亭。
民國71年（1982）6月27日：因旅客人數十分稀少，東拓完工同日德高站正式裁撤，廢站後水泥磚造的候車亭被留存一段時間，後於民國91年（2002）左右拆除。
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月美
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大正11年（1922）5月10日：開業，初名月野驛。
民國51年（1962）12月15日：因行政區域屬關山鎮月眉里，改稱為月眉。
民國52年（1963）5月1日：因與中部糖鐵月眉站同名，改名月美。
民國102年（2013）6月27日：隨著花東鐵路電氣化工程廢站。
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中興
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位於臺東縣鹿野鄉和平社區巴拉雅拜部落。
民國46年（1957）11月1日：為便利旅客乘車，於鹿野站至嘉豐站間增設中興招呼站，由鹿野站管理，中興招呼站規模很小，只設一座水泥磚造候車亭。
民國71年（1982）6月27日：由於中興至檳榔間路線迂迴及坡度過大，於東拓時決定將路線改線，東拓完工，同日裁撤中興站，廢站後的水泥磚造的候車亭至民國92年（2003）左右拆除。
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嘉豐
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大正11年（1922）4月20日：設稻葉乘降場開始營業。
民國43年（1954）3月10日：因地名由初鹿村改稱為嘉豐村，站名更改為嘉豐站。嘉豐站內路線坡度高達千分之21，故將嘉豐站站場設計為折返式車站，也成為了窄軌時期東線的瓶頸路段之一，尤以牽引噸數高的貨物列車更為嚴重，雖然站內有一條直線通過線，但坡度問題依然無法有效解決。
民國71年（1982）6月27日：東線拓寬工程完工通車，同日起嘉豐站正式裁撤。廢站後的木造站房、站場及月台全數拆除。
民國94年（2005）：加水塔拆除。
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初鹿
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大正8年（1919）2月1日：臺東製糖株式會社興建之卑南至北絲鬮間路線完工通車，設立北絲鬮停車場。
大正11年（1922）：改名為初鹿尾，同年4月20日臺灣總督府鐵道部收購臺東開拓株式會社（原臺東製糖株式會社）臺東至池上間之鐵路，同日起改名為臺東南線並改為官營鐵道營運，當時為初鹿尾乘降場，後再升等為初鹿尾驛。
昭和12年（1937）11月1日：改為初鹿停車場
民國34年（1945）：改稱初鹿站。
民國41年（1952）3月：站房改建完工。
民國71年（1982）6月27日：東拓完工通車，同日初鹿站裁撤。廢站後的木造站房、站場及月台均全數拆除，站房原址改建為卑南鄉老人文康活動中心，南側的涼亭公園是月台位置，而原有鐵路拆除後部份路基改建為臺9線公路。
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東成
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民國57年（1968）5月1日：為便利旅客乘車，於初鹿站至檳榔站間增設東成招呼站，由檳榔站管理，東成招呼站規模很小，只有一座水泥磚造候車亭。
民國71年（1982）6月27日：東拓完工通車，同日東成站裁撤，水泥磚造的候車亭至今仍被留存在卑南鄉消防局卑南分隊、美農村辦公處後方小斜坡上。
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檳榔
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大正11年（1922）4月20日：設立日奈敷乘降場，日語「日奈敷」讀作hinashiki，取自當地部落名「檳榔樹格」（pinaski）。
昭和18年（1943）：改稱日奈敷停車場
民國36年（1947）10月6日：改為檳榔，仍為原住民語音譯。
民國45年（1956）：地名由檳榔村改為賓朗村，但站名並未隨地名更改而一直沿用。
民國71年（1982）6月27日：東拓通車後廢止。
檳榔火車站位於卑南鄉賓朗社區，日據時地名由檳榔樹格該為日奈敷，光復後更名為檳榔，民國60年代為拓寬東線鐵路拆除不少車站，檳榔站是少數留存的車站建築，民國71年（1982）6月26日10：50，最後一班列車自窄軌駛離台東後，檳榔廢站，東線窄軌鐵道走入歷史。檳榔站最早為762公釐糖業軌道，日式木造站房依地形落差建物分為上下兩層，上層為票房、站房、候車室，下層為職務宿舍，火車站周邊的木造道班房、廚房、木造廁所及蒸汽火車頭給水塔均保持良好。
賓朗村東起綠色隧道，西至賓朗牧場，北與美濃村交界，南臨太平溪，分為上賓朗、中賓朗、下賓朗、十股、頂岩灣、牧場、後湖與山腳下等聚落，居民多以務農維生，主要作物為釋迦、高接梨、荖葉、檳榔。
賓朗村於民國34年（1945）成立，中賓朗及山腳下居民以閩南人、客家人、外省人為主，上賓朗及下賓朗為卑南族部落，部落的原住民人數不到總人口的25%，是所有卑南部落中比例最少的。下賓朗（檳榔樹格Pinasiki）語意來自paskiski（上斜坡），因部落舊址在北方2公里飆高200多公尺的隆起台地，部落經過三次遷址，昭和6年（1931）在日本政府規劃下遷到現址，社區呈棋盤狀。上賓朗舊名阿里擺（Alipai），螞蟻很多之意，位於下賓朗北方山下平原，現改名頂永豐，當地人仍以阿里擺稱之，基督教堂所在原為卑南族人的成人會所和祭祀場，曾是胡適幼時的故居。
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馬蘭
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大正11年（1922）4月20日：設馬蘭驛。
民國90年（2001）6月1日：停辦客運業務，東線鐵路拓寬後，馬蘭車站成為貨運專用車站，載運臺糖的甘蔗，後來兼載永豐餘臺東紙廠的紙槳原料與中油公司油料。。
民國90年（2001）8月1日：臺東新站至臺東站的鐵道廢除，馬蘭站隨著臺東舊站的裁撤廢止。
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臺東舊站
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大正11年（1922）4月20日：臺灣鐵道部收購臺東製糖株式會社所屬臺東、關山間的鐵路，設臺東驛，同年4月木造臺東驛竣工。
昭和7年（1932）：臺東驛改建完成，由石頭建造，大門邊鑲成白色圓圈。
民國53年（1964）：臺東舊站改建為水泥建築站體。
民國80年（1991）12月：南迴鐵路通車，卑南站改稱臺東新站。
民國90年（2001）5月31日：裁撤臺東新站和舊站間的連線，臺東舊站廢止，臺東新站改稱臺東站。
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臺東海岸
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昭和4年（1929）4月1日：為便利海路貨物運送，新建臺東驛至臺東海岸間路線通車啟用，設立臺東海岸貨物取扱所（辦公室）營運。
民國34年（1945）：改稱臺東海岸站。
民國71年（1982）6月27日：東拓完工通車，同日起臺東海岸站正式裁撤，裁撤後站場改為台東縣農會飼料廠使，於民國104年（2015）停用拆除。部分路線並未完全拆除，留下270.3公尺路線作為臺東站調車線。
民國88年（1999）10月1日：以機車牽引的班次不駛進臺東舊站，此段路線停用。
民國90年（2001）6月1日：臺東舊站裁撤，全線廢止。
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