攝大乘論中的三性-依他起、遍計執、圓成實-以依他起性為中心，因為依他起相乃以「阿賴耶識為種子，虛妄分別所攝諸識」，遍計執相為「無義唯有識中似義顯現」，圓成實相為「於彼依他起相，由似義相永無有性」，也就是當將遍計執去除後的依他起相，就是圓成實了。但是圓成實非依依他起，因為圓成實是以聞熏「最淨法界等流性」的清淨法教而成就的。

而「最清淨法界等流正聞熏習」的過程中，因與阿賴耶是俱生俱滅而形成正聞熏習的種子，而此正聞熏習的種子，雖有下中上品，皆是「法身種子，與阿賴耶識相違，非是阿賴耶識所攝」。此法身種子，藉由聞熏清淨法的過程，「次第漸增」而使得阿賴耶識所攝藏的種子「次第漸減」，直到阿賴耶識「無種子而轉」，則「一切種永斷」-圓成實顯現。

阿賴耶所攝種子漸減與法身種子漸增的過程中，法身種子與阿賴耶所攝種子是俱生俱滅的，而非不生不滅。

瑜珈師地論‧種性地：「謂住種補特伽羅，有種子法。由現有故，安住種性補特伽羅，若遇勝緣，便有堪任，便有勢力，於其涅槃，能得能證。」

此類種子是自「最清淨法界等流正聞熏習」而「寄在異熟識中，與彼和合俱轉，猶如水乳。」

由此觀之，生滅的種子，是能產生不生不滅的涅槃果，而此類無漏的種子乃自最清淨法界等流正聞熏習而形成。

此法身種子，雖「非阿賴耶識所攝」，但「與阿賴耶識同處俱轉」。因此，即使阿賴耶識的染污種子現形成不可愛的果報，法身種子不失，等到因緣成熟，依然能成就聖道。