國民革命軍第三軍，第一次於1925年，由建國第一軍組成；第二次於1948年，由整編第三十八師、暫編第三師等部組成。

民國14(1925)年8月，建國第一軍改編成國民革命軍第三軍，朱培德任軍長。

國民革命軍北伐時期

民國15(1926)年7月，國民革命軍第三軍參加國民革命軍北伐，第三軍編為右翼軍，下轄第七師（師長王鈞）、第八師（師長朱世貴）、 第九師（師長由軍長朱培德將軍自兼）三個師，及一個砲兵營（營長張言傳）、一個憲兵營（營長武宣國），收復江西省會南昌，旋任朱培德將軍為江西省主席。9月，會同國民革命軍第二軍攻打湖南。10月初，第三軍協助國民革命軍第一軍及國民革命軍第六軍攻克南昌。之後，國民革命軍第三軍負責南昌警備。

民國16(1927)年5月初，擴編為國民革命軍第三軍及國民革命軍第九軍，編成國民革命軍第五路軍，朱培德任總指揮。國民革命軍第三軍由王均任軍長。8月1日，被南昌起義部隊殲滅一部。

民國17(1928)年春，國民革命軍重組戰鬥序列，渡過長江，繼續北伐，朱培德將軍受任為第一集團軍第五路軍總指揮，由總司令蔣介石親自統率，下轄第三軍和第九軍兩支勁旅，第三軍軍長由王均將軍升任。國民革命軍北伐完成，國家宣告統一。

1928年8月，國民革命軍遵編遣會議之決議，率先縮編國民革命軍第三軍第七師.第八師.第九師縮編為國民革命軍第七師，原軍長王均任師長。

中原大戰時期

民國18(1929)年1929年3月第七師參加 蔣桂戰爭。10月，第七師再奉令恢復原來第三軍番號，及第十二師合編為第三軍，軍長王均。轉輾作戰於豫、魯、獻、鄂各省。從此以後，第三軍的番號，就再沒有更改過了。第三軍調至徐州參加討伐西北軍。

民國19(1930)年5月，中原大戰爆發，第三軍編入總預備軍團。

第一次國共內戰時期

民國20(1931)年7月中旬，第三軍被編為剿赤軍南路集團軍第三軍團，參加討伐石友三。民國23(1934)年9月，第三軍調往豫鄂皖地區參加圍剿中國工農紅軍。民國25(1936)年11月，曾萬鐘任第三軍軍長。西安事變發生後，被編入「討逆軍」第九縱隊。

中國抗日戰爭時期

民國26(1937)年7月7日，日本軍閥發動蘆溝橋事變，激起了全國軍民震怒，最高領袖　蔣委員長，在江西廬山嚴正發表自衛抗戰聲明，說明犧牲已到最後關頭，全面抗戰正式開始，第三軍隨即奉命北上應戰，星夜馳援，投入華北戰場，在河北省之西南太行山以東一帶，與頑強之日軍纏戰衝殺，歷半年之久，直到民國27(1938)年3月，第三軍始奉命越太行山轉入山西省東南，受第二戰區司令長官閻錫山指揮，繼續抗戰，此時的軍長，為曾萬鍾將軍。8月，因中國抗日戰爭需要，隸屬國民革命軍第十四集團軍。

1938年10月，第三軍歸國民革命軍第五集團軍指揮。

民國28(1939)年第三軍曾萬鍾將軍因戰功卓著，加上另一事功極具勛勞，升任為第五集團軍總司令，所遺第三軍長一職，由唐准原將軍升任。所謂「另一事功」，至今事隔五十年，大可公佈真相。原來民國二十八年，汪精衛以國民黨副總裁之尊，棄其光榮歷史於不顧，悄然由重慶出走，道出昆明，企圖以其極具煽動力之說服仗倆，欲打動雲南省主席龍志舟（雲）將軍，與之採取同一行動。事為中央獲悉，以曾萬鍾將軍與龍主席私交甚篤，急電曾將軍由前線微行趨返昆明，化解了一場緊急，使龍主席終未為汪精衛所說動。故而極具勛勞。7月，由唐淮源接任軍長。

1940年後，因第四集團軍高層和第八路軍來往頻繁，內部眾多中共分子潛伏，甚至一個師中4個團長就有3個是中共黨員或者地下黨員。蔣為防止中條山赤化，命令將此處國軍大部撤離到河南，第一戰區司令官衛立煌奉命回重慶述職。中央軍接管了中條山的防務，而具體指揮則有何應欽負責，但實際中條山的國軍只有第八十軍，第三軍，第九軍為中央軍部隊，其餘4個軍均為雜牌部隊。而第八十軍，第三軍均為中央軍中戰鬥力較差的部隊，第九軍也僅僅屬於二流，其餘4個雜牌軍戰鬥力更是有限。日軍此戰為了徹底消滅中條山的15萬多國軍，不但集中高達12萬多人的主力部隊，而且準備徹底占領中條山，這是同之前13次的掃蕩中條山完全不同。此戰，不但中日力量極為懸殊，就日軍來講，也是自徐州會戰以後在華北最大規模的戰役。日軍前後花費一個月才攻克了中條山，中條山會戰日軍傷亡2萬多人，國軍傷亡7萬5千多人。

民國30(1941)年5月初，日寇集結眾多精銳武力，大舉進犯山西南部 中條山會戰，9日，雙方展開激烈戰鬥，第三軍首攖其衝，此為日軍亟欲肅清太行山西南以及中條山東南此一狹長地帶之抗日力量，所採取的一次大規模軍事行動，也是第三軍自河北省西撤以來，所參與的最慘烈的一次戰鬥，一般人稱之為中條山第十二次會戰。第三軍全體將士，前仆後繼，視死如歸，戰鬥之慘，犧牲之烈，直可驚天地而泣鬼神，官兵傷亡殆盡，戰至12日，第三軍軍長唐准原將軍，壯烈成仁，與唐軍長一同殉國者，尚有師長寸怡奇將軍，以及第六十八團楊團長（惜已忘其名，無可稽考。）等高級將領多人，死事之烈，由此可見。第五集團軍總司令曾萬鍾將軍，於激烈戰鬥之後，隻身脫險，並獲當地一位篤實農夫的掩護，逃出戰場。然而，這一支首先投入對日抗戰的滇軍，經過這一場慘烈戰鬥之後，可謂已經精銳盡失，元氣大傷，而曾萬鍾將軍，也悄然返回雲南，隱居遁跡，不知所終了。

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民國30(1941)年7月，第三軍重組，由周體仁任軍長，隸屬國民革命軍第三十四集團軍。

第三軍的重組與最後消失
經過中條山會戰第十二次會戰，高級將領中多位成仁殉國，第三軍的番號，雖仍奉令保持，人員重新補充編組，調到關中整訓，但第五集團軍則因此一戰役而撤銷，重組的第三軍，1945年1月，第三軍則改隸第三十八集團軍總司令董釗將軍指揮，軍長為羅歷戒將軍，下轄第七師（師長李用章將軍）、第十二師（師長陳子幹將軍），及新編第三師（師長邱開基將軍）。

第二次國共內戰時期

1947年，國民革命軍第三軍被晉察冀野戰軍全殲。

 抗戰勝利以後，第三軍奉命東出潼關，踵新八軍八軍長高樹勛）之後沿平漢路向北挺進，接收冀南，不幸高樹勛率部譁變，投降中共，致第三軍遭受意外夾擊，軍長羅歷戎因之被俘，所部潰散，至此為止，第三軍即告消失。

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1948年初，整編第三十八師(原第三十八軍)第十七旅與新編第九師、暫編第三師等部合編為第三軍，許良鈺任軍長。同年5月，第三軍改編為整編第十六師，原軍長許良鈺任師長。9月，整編第十六師改稱為第三軍，隸屬西安綏靖公署。

番號消滅

1949年底，第三軍在國民革命軍第五軍團編成內，被中國人民解放軍全殲於四川西部新津、邛崍地區。