甲狀腺的問題，並不是侷限在功能上的探討，也不是侷限在構造上的問題。一個人甲狀腺功能出了問題，其構造上可能是正常，也可能只是單純性腫大，也可能出現結節；反過來說，甲狀腺的構造出現異常，其功能可能是正常，也可能是亢進，也可能是功能低下。常常有人會問說，甲狀腺有問題是要限制碘的攝取或是要多攝取含碘的食物？這需視患者不同的情況而定，不是每個甲狀腺患者都有相同的答案，正要看患者的功能和自體免疫抗體存在與否來決定。所以甲狀腺疾病的檢查絕不是單一種方法，要從『功能』、『構造』、『抗體』來加以檢查。
甲狀腺功能檢查
甲狀腺功能可區分為：功能正常、功能亢進和功能低下。在檢查時可由血液的變化得知，常做的檢查有TSH,T4,T3,free T4,T4 uptake等等。但不是每一個懷疑甲狀腺機能異常者，每一項檢查都需要做，最主要還是依照臨床病史和理學檢查之後再做決定該做哪些檢查，像懷疑是機能亢進時，可做TSH, T4, T3，當然先做一項T4也是可以的：當懷疑是功能低下時，TSH的準確度是比T4和T3來得好一點。另外也可用核子掃描檢查來做進一步的區分，不過對功能低下就比較沒有應用的價值。
甲狀腺構造(甲狀腺腫或結節)檢查：
甲狀腺構造異常的檢查方法有：甲狀腺超音波、核子掃描、電腦斷層掃描、磁共振檢查。這幾種方法以甲狀腺超音波最好，因其不具輻射性且價格便宜，解析度好，是目前應用最廣、最普遍的檢查方法。
若能同時能配合細針穿刺細胞學檢查，對甲狀腺結節的檢查更有價值。在下列幾種情況，最好同時接受超音波和細針穿刺細胞學檢查 ：
1. 單一甲狀腺結節。
2. 多發性甲狀腺結節，尤其對存在有低超音波密度之結節。
3. 甲狀腺囊腫。
4. 瀰漫性甲狀腺病變，臨床上懷疑橋本氏甲狀腺炎。
5. 為了區分急性和亞急性甲狀腺炎之病例。
(在有出血傾向病患和甲狀腺功能亢進病人在功能亢進階段的情況下並不適合做細針穿刺細胞學檢查)
甲狀腺自體免疫抗體檢查：
甲狀腺自體免疫抗體有：AMA (anti-microsomal antibody)、ATA (anti-thyroglobin antibody)、TBII
假如AMA呈現陽性反應，將之歸類為自體免疫出現問題，此時最好能盡量避開攝取含碘食物，以防免疫反應過於激烈，造成甲狀腺細胞的破壞。當TBII呈陽性反應時，葛瑞芙氏病(Graves' disease)的機會就大增。
當一開始自體免疫抗體呈陽性反應的機能亢進患者，在治療之後，可當做將來判斷是否復發的預測因子。
另外，甲狀腺球蛋白(Thyroglobulin)是一種甲狀腺癌復發的指標，並不是甲狀腺癌篩檢的腫瘤標記。
甲狀腺有什麼問題，該做什麼檢查有一定的準則，並不需要什麼都做。
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