1771年12月，原本的薩爾茲堡主教Sigismund von Schrattenbach去世，第二年三月，Count Hieronymus von Colloredo 被選為繼任主教，這一件事無論對莫札特或是他的家庭都產生了重大的影響，原本的Sigismund主教喜愛藝術文化，對莫札特的音樂天才很尊重，也曾經資助過莫札特父子的外出演奏，但是新任的Hieronymus主教對莫札特的態度就天南地北的相反，歷史上對這位主教的評價並不高，因為他的專制與跋扈，薩爾茲堡的聖職人員與當地官員對他充滿敵意，百姓也對他十分冷漠，無論在藝文活動或是在彌撒禮儀上，他都立下了很多嚴格的規定與限制，這使得莫札特與主教之間的關係十分緊張，兩人之間衝突不斷，1777年，主教拒絕了莫札特想外出演奏的申請，莫札特於是提出離職的要求，結果主教的回應，竟是同時間將莫札特父子二人的職務都解職了，當然，不久之後老莫札特還是被允許復職，但是兒子莫札特卻是慶幸的以為解脫了，於是就拉著媽媽，即刻起身前往過去曾經旅行過並且在那裡享有大名的城市，企圖在那些藝文重鎮之中可以謀得任何職位，可惜這趟旅程總歸來講十分失敗，無論在尋找工作上、演出機會上，甚至在感情上都落空，更難過的是，1778年七月，當他們在巴黎的時候，母親終於受不了旅程的勞頓而染病去世，這對他而言是很大的打擊，終於在父親的催促之下，於1779年一月回到薩爾茲堡，繼續在主教面前工作，一直到1781年。

在薩爾茲堡主教面前供職的這段時間，身為宮廷管風琴師，除了在教堂與宮廷中彈奏管風琴，還包括了教導兒童合唱團與作曲，在聖樂方面，大部分的彌撒是在這段時間寫作的，由於主教要求全部彌撒時間不超過四十五分鐘，莫札特在這段時間所寫的彌撒都是屬於小彌撒的規模。而其中最有名的就是1779年寫的「加冕彌撒」（The Coronation Mass in C major, KV 317）了。關於這首曲子的寫作背景，有很多傳說，但是都無法證實，基本上，它並不是為了任何一個加冕大典所做的，「加冕」這個詞應該是後來人冠上去的，縱然如此，這首曲子是莫札特彌撒曲中最常被演出的一首，甚至被當作神學議題來討論。

Missa Încoronarii în Do Major, KV 317

http://www.youtube.com/watch?v=lkG2THIBPpg&feature=related

1781年三月，主教帶著一群隨從到維也納參加約瑟夫二世的一個慶典，莫札特原本有機會在皇帝面前演奏，卻被主教拒絕了，這造成兩人的正式決裂，莫札特在眾人面前被主教言詞辱罵並且趕了出去，莫札特從此定居維也納，成為自由藝術家。

莫札特在維也納的這十年可說是創作最自由豐盛的時期，我們最常在舞臺上聽到的名曲，無論是歌劇、交響曲、鋼琴曲或是器樂曲大多出自這個黃金十年，但是在宗教音樂方面卻是十分的稀少，這一方面，是因為他離開了宮廷，不再有寫作宗教樂曲的責任，另一方面也可當作他對主教所代表的教會權威的反感，另外，約瑟夫二世時期的維也納並沒有給教會音樂的創作留下足夠的空間。

1782年八月四日，莫札特與與康茲坦采˙韋伯（Constanze Weber, 1762-1849）結婚，這個結婚的對象，與莫札特的關係有一點複雜，在維也納藝文圈也算是小有名氣，莫札特在之前的外出旅行時，在曼漢就已經結識康茲坦采的姐姐艾洛伊莎（Aloysia Weber, 1761-1839），並且陷入熱戀，但是這段戀情很快就結束了，莫札特在維也納的時候，先是在韋伯夫人的家中住了一段時間，後來因為他與韋伯夫人的三女兒交往的消息傳了出來，為了避免紛爭，他曾經搬離韋伯的住所，但是之後還是跟康茲坦采結婚了，為了這段婚姻，他譜寫了C小調彌撒，這其中的動機可說是蠻有趣的，一個原因是，準新娘生病了，他似乎把譜寫這首彌撒曲當作可以順利結婚的許願，因為他曾經在與父親的信上面提到他是如何的擔心新娘子生病這件事，以及這首彌撒是他對上帝的誓願，另一方面，因為父親蠻反對這段婚姻的，他似乎有意藉這首彌撒的演出來向父親介紹這位兒媳婦，因此，這首彌撒中有很多女高音獨唱，應該是為了康茲坦采寫作的。

然而，這首彌撒並沒有完成，但是卻於1783年十月在薩爾茲堡演出，這也看的出來他急著希望藉著這首曲子將新婚妻子介紹給父親的企圖，縱然來不及寫完，還是要演出，這首彌撒曲完成的部份，是慈悲經（Kyrie）與榮耀頌（Gloria），信經（Credo）開始了一個部份，歡呼歌（Sanctus）與迎主曲（Benedictus）譜寫了大部分。

Mass in C minor, K427

Kyrie

http://www.youtube.com/watch?v=zuFA3DmglwI

Gloria

http://www.youtube.com/watch?v=OVL2V8GQpgw&feature=related

C小調彌撒是一首沒有完成的彌撒，並且從史料中也看到莫札特根本沒有要完成它的意願，學者探討其中的原因，首先是創作動機來看，他沒有要創作宗教音樂的希望，所以既然婚也結了，也演出過了，就沒有任何要繼續寫的動機了，除此之外，從薩爾茲堡回到維也納的莫札特忙於其他樂曲的寫作，根本無暇也沒興趣再管這首曲子了，學者也告訴我們，這段時間的莫札特熱中於一個社團的活動，這個社團叫做共濟會（Freemasonry），這個團體是個純男性的社團，主旨在宣揚寬容、友愛之弟兄之情，不談宗教與政治，但是這個社團的聚會形式卻是蠻有宗教禮儀形式的。莫札特就為了這個這個社團寫了不少共濟會音樂。

Mozart’s Eine kleine Freimaurer - Kantate KV623

http://www.youtube.com/watch?v=3IotNiiR55Q