台灣是世界的一部分，台灣不是中華人民共和國的一部分，台灣的國家總體目標不能離開世界的發展與變化。兩岸人民曾經擁有共同的血緣、文化和歷史背景，歷史的緣故讓兩岸發展出相當不同的政治制度和生活方式，但是如果以積極的態度來看待兩岸發展的「異」與「同」，應該可以善加利用，走向進一步合作互惠的關係，共同營造一個「和平發展、自由選擇」的環境。

維繫台海的和平穩定、保持台灣經濟發展與政治民主的優勢，是我們一貫的思維及政策方針；而建立平等互惠、共存共榮的互動架構，也是我們一直追求的終極目標。智慧及創意是目前兩岸之間最需要的，我們誠心期待對岸願意秉持「善意和解、積極合作、永久和平」的原則，以最大的氣度和前瞻的智慧，和台灣進行交流，逐步建立彼此間的信任，並共同尋求兩岸永久和平、政治統合的新架構，為兩岸人民最大的福祉，開拓無限可能的空間，也為亞太地區的繁榮與穩定做出重大的貢獻。

為了兩岸政策呈現穩定開放的一貫性，陳總統先後召開兩岸關係跨黨派小組及經發會，為全力推展改善兩岸關係凝聚台灣朝野的共識；政府並推動：金馬小三通、開放大陸記者來台駐點採訪、開放大陸人士來台觀光、允許大陸配偶來台工作、持續以「積極管理、有效開放」的經貿政策。

政府逐步推動兩岸經貿正常化發展，到目前為止，已經推出許多項善意開放政策，也看到了階段性的成果：（一）開辦台商子弟學校（二）開放大陸記者來台駐點採訪（三）試辦金馬小三通（四）分階段開放大陸人士來台觀光（五）推動兩岸金融業務往來（六）加強照顧大陸配偶（七）完成台港台澳新航約簽署（八）開放國內業者赴大陸投資房地產（九）實施春節台商返鄉包機（十）公布為兩岸直航協商評估報告（十一）全面修正兩岸條例（十二）推動兩岸貨運便捷化措施。

陳總統上任六年多來，努力營造追求兩岸共存共榮的共識，也一直期待能與中共方面進行理性、務實的對話協商。陳總統一再重申就職以來的立場，即「善意和解、積極合作、永久和平」的原則，並於去年二月三日，發表「和平穩定互動架構」的重大宣言；五二○就職演說中提出以「和平與發展」為主軸的兩岸政策方向；雙十國慶文告之中，更進一步揭示兩岸和平對話的基礎，以及具體可行的政策項目，宣示追求對話、維護和平穩定的決心。這些重大政策宣示，一方面表達我國捍衛台海現狀的決心，另一方面讓國際社會瞭解，我國雖然面對嚴重軍事威脅，卻有追求和平的勇氣與信心。

未來政府大陸政策將分短中長程推進，在短程上，將推動兩岸交流與協商，包括兩岸新聞、文教及經貿交流的漸次擴大，並針對三通議題在排除政治障礙下進行協商，及兩岸各項實質的議題，進行對話協商簽定協議；中程階段希望建立兩岸和平穩定互動架構，包括雙方互派代表、解決政治關係、建立兩岸軍事互信機制、成立「兩岸和平發展委員會」、訂定「兩岸和平發展綱領」，希望透過兩岸和平互動架構，規範兩岸在過渡期間之往來行為；長程目標，則希望解決與中國大陸彼此間的政治岐異，只要臺灣人民同意，不排除與中國大陸建立任何形式的政治關係。