財政部臺北市國稅局表示，替代役役男取得內政部役政署給付之薪餉免納所得稅，但第3階段研發替代役役男取自用人單位給付之薪資所得者，應合併其他各類所得申報納稅。

該局說明，依替代役實施條例第4條、第5條之2及第8條規定，替代役之類別區分為一般替代役及研發替代役，研發替代役之役男依其服役期間分為第1、2、3階段。一般替代役及第1階段、第2階段研發替代役役男之薪俸、地域加給及主、副食費，係比照國軍義務役軍官、士官、士兵標準發給，依財政部96年5月28日台財稅字第09604047670號函規定，此類替代役役男之薪餉，其課稅應與常備役之薪餉一致，可適用所得稅法第4條第1項第1款現役軍人之薪餉免納所得稅之規定。至第3階段研發替代役役男，因係與用人單位具僱傭關係，其薪資係依勞雇雙方契約約定，依財政部97年10月31日台財稅字第09700478550號函規定，受領之薪資，與前述一般替代役及第1階段、第2階段研發替代役役男自政府領取法定薪餉，尚屬有別，並無免納所得稅之規定。因此，用人單位於給付是項薪資時應依規定辦理扣繳，該第3階段研發替代役之亦應依規定申報納稅。

該局呼籲，納稅義務人應注意相關稅法之規定，以維自身權益。

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