腸道內的菌群生態與宿主的健康息息相關，有益菌與有害菌各自有其生化特性。有益菌之所以稱為有益菌，有害菌之所以為有害菌，乃根據其生化特性所表現出來對人體健康的影響性作定義的。宿主要健康，必得對人體健康有正面效果的有益菌需增加，而對人體健康有不利影響的有害菌則需減少，這就是我們所謂的「優良的腸道內菌群生態」。

當比福多菌數量增多時，表示上圖所示的各項功能將有更多的執行者為維護宿主的健康而努力的工作著，當然成效會更為顯著而有效。

另外，由各種不同年齡，各種不同身體狀況者的糞便檢測其比福多菌含菌數時，得到了一個很明確的結論。年齡越輕，身體健康情況越好的人，被檢測出的比福多菌數量就越高，且活性越強。反之，一個住院中的年老病人，其比福多菌數量會大幅降低，有可能幾乎接近於零。