一、交通警察總隊

抗戰期間，軍統局擁有了自己的強大武裝力量：忠義救國軍、別動軍、稅警總團、交通巡查總隊。

1946年1月，國民政府正式頒佈裁軍整編命令。

對於軍統武裝部隊的整編，於1946年3月1日正式施行：整編為交通部交通警察總局，下轄十八個交通警察總隊、一個總局直屬大隊及京滬、粵漢兩個鐵路警備司令部；每個總隊兵力為四千人左右，由四個大隊組成，全部為美械。

由於交警總隊的所有軍官幾乎全部畢業於中美特種技術合作所及軍統各訓練班，且在抗戰中積累了大量敵後遊擊作戰經驗，加上武器裝備精良，因此被稱為“袖珍王牌軍”。但很遺憾，交通警察部隊3月1日建立，17日戴笠便罹難了。

1、華東及中原戰場：

第1、2、7、9、11、15、16、17總隊

2、東北戰場：

第3、8、13、14總隊（第13、14總隊1947年6月改編為新六軍169師）

3、華北戰場：

第5、10、12總隊

4、長江以南：

第4、6、18總隊及五個教導總隊（1948年初）。

徐蚌會戰後，又成立了四個交通警察旅，集結於上海地區。

交通警察總局第一任局長：吉章簡，黃埔二期，原在胡宗南部任新七軍代軍長，抗戰後期調任軍事委員會交通巡察處處長；1948年3月，因與毛人鳳關係惡劣而被解職；

第二任局長：周偉龍，黃埔四期，抗戰期間任軍統漢口站站長、忠義救國軍總指揮、別動軍總司令；1949年2月，周偉龍企圖聯合程潛、唐生智投共，被毛人鳳下令逮捕槍決；

第三任局長：馬志超，黃埔一期，抗戰期間任蘭州市警察局長、新34師師長、第八戰區政治部副主任、忠義救國軍總指揮；抗戰勝利後，任交通警察總局副局長兼山東辦事處主任；接任周偉龍職務後，負責協助湯恩伯防守上海；大陸淪陷後，撤至臺灣。

二、快速縱隊

第一快速縱隊：成立於1946年9月，以李良榮28軍第80師為基幹，配備戰車1團第1營（共坦克45輛），及四個榴炮營、1個汽車團；以裝甲兵教導總隊總隊長石祖黃（土木系）任司令官；配合馬勵武（湯恩伯系）26軍進攻魯南；

11月中旬，石祖黃因與馬勵武不和而離職；由79軍24師師長車蕃如（土木系）繼任第一快速縱隊司令官；

12月底，車蕃如因與馬勵武不和而離職；由副司令官鄒震岳代為指揮；

1947年1月4日，第一快速縱隊於嶧縣以東覆沒，僅鄒震岳率7輛坦克逃出；粟裕以此戰繳獲的28輛坦克、48門105榴彈炮及汽車400余輛成立了華野特種兵縱隊；

縱觀第一快速縱隊的覆沒，只能說當時的國軍將領上到薛岳，下至馬勵武，對現代戰爭知識、對步坦協同作戰，知之甚少；對大雨、暴雪、地形、地貌會對坦克、重炮部隊造成何等影響，一無所知。

1947年11月，以邱清泉第5軍96師為基幹，重建第一快速縱隊，96師師長鄧軍林為縱隊司令；

1947年底，第一快速縱隊改隸高吉人70軍；第5軍擴編為整編第五軍，轄第5、第70軍；

徐蚌會戰，第一快速縱隊隨邱清泉兵團覆沒于陳官莊；

第二快速縱隊：與第一快速縱隊同時成立，以原胡宗南系統的27軍49師為基幹編成，編成後隸屬王仲廉整編26軍，49師師長李守正任縱隊司令官。該縱隊戰車及重炮數量僅為第一快速縱隊的一半。

1947年4月，該縱隊於豫北被劉伯承共軍殲滅，李守正被俘；

1947年11月，孫震第五綏靖區所轄第41軍、47軍合編為整編47軍，孫元良任軍長；以47軍125師為基幹，重建第二快速縱隊，125師師長陳仕俊（又名陳玲）任縱隊司令官；

該縱隊於1948年11月6日晚，於豫皖交界處夏邑覆沒，陳仕俊被俘；

第三快速縱隊：與第一快速縱隊同時成立，以羅友倫青年軍207師傅宗良第1旅為基幹編成（當時該縱隊隸屬北平行轅）；1947年5月，更名為東北保安司令長官部第二快速縱隊，羅友倫兼任縱隊司令官；該縱隊1948年11月初于瀋陽覆沒；

1947年5月，在關內以傘兵總隊為基幹另行成立第三快速縱隊，以傘兵司令馬師恭任縱隊司令官，由陸總徐州指揮所直轄；

1948年7月，第三快速縱隊與第二交警總隊、黃百韜25軍組成「黃百韜兵團」，參加豫東會戰，傷亡過半；戰後，該縱隊番號取消；

第四快速縱隊：1947年11月，胡璉18軍擴編為整編第十八軍，轄第10軍、第18軍；

1948年3月，以18軍118師為基幹組成第四快速縱隊，該師師長尹鐘岳任縱隊司令官。

1948年12月中旬，該縱隊隨黃維兵團於雙堆集覆沒；尹鐘岳被俘。