彰化縣志: 卷十一、雜識志、兵燹
「乾隆四十年壬寅【十二】月，泉、彰民分類械鬥」（有設賭場者，適泉人與彰人同賭，因換呆錢起血半，始僅口角，繼則鬥毆，終釀械鬥巨禍。邑之有分類自此始。）
「嘉慶十一年丙寅春二月二十有七日，泉、彰民分類械鬥。」（....鄉勇皆彰人、甫入鹿之安平鎮街，與轎店小夫惡語相詆，即發鳥槍，傷斃數人。.....途遇泉人輒殺之。....而最慘者，唯沙轆一帶泉人，望風而遁，渡海溺死，及被沿途截殺，不可勝計。....至六、七月，乃各歸莊平定。） 「嘉慶十四年己巳四月十六日，泉、彰民分分類械鬥。」 「道光六年丙戍夏四月，閩、粵奸民分類械鬥」 命名生物種類，將這些種類放置在大小階層的類別中，在中文稱為生物分類，在英文，則是biological classification。字典中，classify的意義有二，分別為：（1）依類別排列，或（2）將之放於類別中；梁實秋編譯之漢英牛津辭典中，則將classify翻譯為「分類、歸類」。但在中文的用法中，似乎只強調了「分類」的部份，從來也沒有見過有人使用「歸類」一詞。影響所及，我們見到所有人都在強調分類，總是要從任何人、事、物中，找出和別人不同的地方，把所有的東西越分越細。伋伋分類的結果是，大多數人都忘了整體是甚麼，分出來的東西最先是屬於哪一個大類的。後果是只強調不同的地方，而忘記了相同的部分。同是一個國家的人，要分縣市；同縣市的人，要分宗族；同宗族的人，要分房；同一房的人，要分長幼輩份；同輩的人，要分男女；同性的人，要分美醜。最後，大家只會要比美。要分類，人可以無止境地分到最小的層次，但是盡頭在哪裡，沒有人關心。因為一但分類分上癮了，是無法戒掉的。 地球有生命到現在也許已經有30億（3,000,000,000）年了，現在生存的每一個動物門，其成員的祖先少說也有4億年的歷史。生物是會改變的，後代和祖先也肯定不會長得一樣，那麼到底有沒有可能由現在長得如此不同的動物中，找出之間的親源關係？我們得到的親源關係是不是可信的呢？如何去印證呢？還有，問個比較實際的問題，知道了又有什麼用呢？ 生物學中各類純粹及應用研究的領域極多，數數看，有些領域是不用知道（或認為沒有必要知道）生物間親源關係的，像細胞學、分子生物學、醫學、生理學、生物化學；有些領域是需要知道一些的（但也有些人認為無關緊要），如生態學、農業科學、微生物學、形態學；也有一些學門是靠著生物間親源關係的架構或思考模式，在進行研究的，像歸類學、生物地理學、演化學、遺傳學等。可惜每個人的一生太短，所能研究的範圍有限，光是有關人類的研究便消耗了絕大多數的金錢、人力、智慧；而除了人以外的百萬千萬種生物，能夠叫得出幾種的名字，就已是了不得的事了。至於知道節肢動物到底是和環節動物還是軟體動物有最近的祖先，就不是一般人或是絕大多數念生物的人所關心的問題了。 生物學是兩極化的科學。一方面研究分子生物、生物化學、生理學的人有著reductionist的看法，他們在尋求用簡化方法解釋所有生命現象。另一方面，系統歸類、演化學卻是在探索這多變的生物世界，介紹人們多樣而又看似毫無規律、充滿著意外及例外的生物及其現象。而所謂「兼顧派」則是在這兩極化中找出一個點，一方面談談比較常見、不太有意外的「多樣性」，一方面強調「簡單就是美」的簡化思考模式。在國中、高中的生物課本，我們看到的便是這樣的東西：教多樣性，卻又不肯教太多樣；教法則，又不教原因。進了大學，念了生物科系，正是讓人有機會真正的見到最多樣性的，還有最一致性的生物學領域，也許這樣才能造出一些有獨立思考的人出來。
系統歸類學就是用科學的思考模式，根據生物學中最一致性的原理（演化），從最複雜、最多樣的生命中，找出最可能的生物之間的親緣關係。這就像打靶。真理是靶心，研究法是步槍，而知識是瞄準呎及準星。第一發子彈打出可能連靶都沒碰到，但是由調整瞄準尺及準星，可以逐漸接近靶心，甚至正中紅心。但是將靶再放遠到步槍射程之外時，若我們還想要打到靶，或接近靶，就要換一隻射程更遠的步槍，再以相同的調整方法，去試圖打到紅心。 歸類（或分類）包含三項主要的工作，第一是分類，如何由各類生物中，利用各種形態、遺傳、行為、生態特徵，辨別不同種類；第二是歸類，如何將各種不同的種類，依據某些原則（親緣關係）歸納整理在各類群中；第三是命名，將分類及歸類結果，利用生物命名法則，給予正式的名稱。 當我們不關心親緣關係，或是不能理解演化過程或演化造就出來的模式時，很難去關心周遭各類生物的獨特性。而不以演化及生物親緣關係為基礎的生物學研究，是無法有突破性的進展的。 由歸類的觀點和其穩定性來看，「種」是一個最容易被人接受的實體，也是一個比較穩定的觀念。「門」應是次於「種」最穩定的分類單位了。其間的綱、目、科、屬，似乎說變就變，而且同時間可見到好幾種不同的歸類方式，但是「種」或是「門」好像不容易變動。其實這只是因為人所能見到的，只是靜止狀態下的生物影象。 同一種的生物，我們不容易把它弄錯。但是"種"一定屬於某一"屬"，"屬"又一定屬於某一"科"。歸類學家不會弄錯種，但時常會無法決定這個種是哪一屬或哪一科。這並不是歸類學家的錯，這是科學進展的必然現象。新種的發現，新特徵的發現，都可以讓人重新檢討原來的歸類系統－過去認為應屬於同一目的兩個科，現在卻認為每一科應各自屬於另外兩個不同的綱。所以不要認為只有推翻相對論、推翻運動定律才是科學的新發現；推翻原有歸類系統，也一樣是生物學中的大事（至少，提出新的歸類系統，可以讓許多人都很難過）。 同屬於一個「門」的生物，都遵循其特殊體制（Bauplan）。所以也很少發生一個新種不知該放到那個「門」的情形。但這也不是永恆不變的真理。果真有人發現到不知該屬於哪個門的奇怪的生物時，便會新創一個「門」來容納它。 有些人會把數個門合而為一（如lophorphorate包含Bryozoa，Brachiopoda，Phoronida；或所有假體腔動物合而為Aschelminthes）；另一個極端是有人會把節肢動物分成三個門。嚴格說來，每一個歸類單位（門也不例外）應是包含其祖先及其所有由祖先衍生出的所有後代種。 動物包含32～36個門，這其中親緣關係的最大問題，是在於門以上的歸類階層（理想的情況，這個包含某幾個門的新的階層，也應是包含那幾個門共同的祖先及所有後代）。因為作這個組合的目的是在找出關係，所以重點是放在門和門之間的相似性及特徵演化的關連性，而不是列出它們之間的差異。這時，爭論就更大了。不僅是特徵的演化方式有人質疑，選用哪個特徵、以什麼方式解釋特徵意義，都會是辯論的焦點。 一般書上介紹脊椎動物的方式，總是以軟骨魚—硬骨魚—兩生類—爬蟲類—鳥類—哺乳類的順序。這一方面，有化石上的証據顯示各類大約的出現順序，但更重要的是，符合我們以人為主的心態投射出的一個完美形象，以及滿足我們作為世界主宰的夢幻（夢魘是更好的說法）。 無脊椎動物，也是以同一個形式出現在現今各階段生物教育使用的教材中。原生動物接下來是腔腸、扁蟲、線蟲、環節、軟體、節肢—最終以棘皮動物完結。而那些小的動物門，在各個版本的書中也都是出現在順序一樣的地方。若是書中談到演化，也都是以二胚層變三胚層、無體腔變假體腔到真體腔、原口類演化成後口類。這樣一層層的二分法的親緣關係排列方式，是由19世紀Haeckel開始，到Hyman完全成形。這些書的描述方式，也完全的忽略了現今對某些動物門在演化上位置的爭論，而讓所有談到的人都完全（不得不）接受了作者所列舉出的強力証據。 事實上，從Hymen所著的經典，無脊椎動物學系列（1940, 1951 a, 1951 b, 1955, 1959）出現後，對於動物門的演化順序及親緣關係有極多不同的論點。有人認為後口三胚層是比原口類三胚層動物或無體腔動物更原始（Siewing 1976, 1980）；有人認為輻射卵裂比較早（Nichols, 1971）；也有人認為後口類是由類似環節動物演化而來（Gutmann, 1981）；Clark（1979）則提出真體腔動物是多次演化而來；也有人認為後生動物是由不同的原生動物演化而成（Nursall, 1962）。如今，更有新的證據，將許多動物門在演化樹的位置作了大搬風（Halanych, 2004）。 不論這些說法是多麼不同，而每種說法都各有一些優秀的生物學家在支持。最重要的觀念在於，大家都希望能了解動物間的演化親緣關係。只是每個人可能都只用到少數幾個特徵，或是只用到每個門中的一兩種動物作代表。其結果自然是造成多樣演化樹。 歸類學中最重要的工作是在瞭解演化過程中，生物是如何的改變，生物間的關係如何，怎麼從現代的生物去推論過去的分枝過程。當然發現新種、命名新種，是分類學中最基本的工作，能夠由許多種類中，找出其中的規律、清出頭緒，便要靠更高層的科學訓練了。
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