動力來源
F-CK-1的動力來源為2具美國蓋瑞特公司(Garrett，註1)與航發中心合作研發的TFE-1042-70(即美軍編號F125-GA-100)渦輪扇發動機，發動機旁通比0.46，壓縮比19，重量617kg，每具可提供2749kg(6060lb)的軍用推力及4291kg(9460lb)的後燃推力，使F-CK-1的戰鬥推重比約達1.0，發動機本身的推重比則為6.96。無後燃器型的F124-GA-200在1998年曾外銷77具到捷克，供L-159高級教練機使用；2005年外銷4具至義大利，供M-346高級教練機的原型機使用。

註1：蓋瑞特公司的航空發動機部門後為漢威公司(Honeywell)所併購。

整具發動機的運作是由全權數位發動機控制系統(FADEC, Full Authority Digital Engine Control)控制，可增進發動機反應速度及燃料使用效率。另外機上裝有1套緊急動力系統(IPS, Integrated Power System)，在發動機熄火後會自行重新啟動。

發動機對戰機性能影響頗大，早期美方更限定單具後燃推力為3788kg(8350lb)，所以「F-CK-1推力不足」的傳言一直揮之不去。我國不斷向美方爭取提昇發動機的推力，目前至少已達到4291kg(9460lb)以上，且TFE-1042-70B型發動機還有很大的改良空間，將推力提昇至4536kg(10000lb)以上只是時間早晚而已。而F-CK-1原型機在首飛時，其爬昇及空中加速性能即讓伴飛的F-5E及F-104望塵莫及，更遑論量產型機。

有此傳言，當年美方為限制F-CK-1的對地攻擊能力，故在飛機上加裝推力控制器，當起落架處於放出狀態(如停於地面)，推力就被限制在某一等級，如此最大起飛重量便無法增加，這意味著F-CK-1無法攜帶太多沈重的對地攻擊武器。

當飛機起飛離地、起落架收回後，限制便會解除而回到全推力狀態，如此空戰性能便不受影響；這個不合理的限制，一直到1997年4月首批F-16A/B Block20返國服役後才解除。

飛控及航電系統
F-CK-1採用1套三重多工數位線傳飛控系統(FBW, Flying By Wire)、抬頭顯示器(HUD)、抬頭顯示儀(HUD, Head-Up Display)、手置節流閥及操縱桿(HOTAS, Hands On Throttle and Stick)、2具多功能顯示器(CRT)等，可使飛行員在執行任務時不必低頭看儀表，雙手不必離開油門及操縱桿便可發射武器及控制作戰所需系統，並提供飛行員完整的作戰資訊作參考之用，航電設計概念相當先進；而漢威公司的H-423雷射慣性導航系統，則提供精確導航及快速起飛能力。

空用雷達是以原F-20使用的AN/APG-67(V)加上部份F-16C使用之AN/APG-66A雷達模組，整合發展而成的金龍53(GD-53)脈衝都卜勒(Pulse Doppler)多功能雷達，金龍53採模組化設計，具俯視及仰視功能，最大搜索距離約可達150km，並擁有多種對空及對地攻擊模式，可導控天劍、響尾蛇(Sidewinder)空對空飛彈對敵機進行攻擊。

機上裝備利頓公司(Litton)的ALR-85(V)1威脅警告系統、崔可公司(Traco)ALE-47智慧型干擾絲/熱焰彈投射器，可大幅提高F-CK-1的戰場生存性。機上其他航電系統包含超高頻/特高頻(UHF/VHF)無線電通訊系統、戰術導航儀(TACAN, Tactical Air Navigation)、敵我識別器(IFF, Identification Friend or Foe)、儀器進場降落系統(ILS, Instrument Landing System)等。

ALR-85(V)1是1套先進的威脅警告系統，但僅具被動接收而沒有主動干擾的功能，不似法製幻象(Mirage)2000-5戰機集完整的威脅警告與主動干擾於一身，而F-16 Block20則可掛載ALQ-184(V)7電戰莢艙，主/被動電戰能力也算完整；但以F-CK-1較小的機身掛上電戰莢艙，飛行性能會受影響，較可行的做法是在機背上加裝適形電子艙，使對飛行性能的影響減少到最低，卻可獲得強大的主/被動電子戰力。