1953年1月，空軍第10空運大隊旗下的第104中隊奉派進駐台北松山機場，支援政府單位各項空運勤務。1954年7月奉令撤消原中隊番號，人員及所屬裝備的16架C-47運輸機，改隸松山基地的飛行大隊，部隊番號改稱「專機中隊」。

現今的空軍專機隊與總統座機組，皆隸屬於空軍松山指揮部的編制之內，總統座機組配屬1架編號3701的波音(Boeing)737-8AR總統行政專機(AR為原廠賦予我國空軍機型識別編號)，專機隊則配屬11架雷神公司(Raytheon)旗下畢琪飛機公司(Beech Aircraft)製造的BH-1900C行政專機(原編制12架編號1901〜1912，損失1架1905)以及3架福克(Fokker)50行政專機(編號5001〜5003)，擔任高級將領、各部會首長或重要國外賓客的運輸服務。

737-8AR總統行政專機加裝通訊系統，在戰術需求上除與民航各塔台構連外，在設計上主要與空軍戰管系統構連，使總統行政專機可接收空軍強網系統的資訊及導引，足以讓總統在行政專機上與國軍戰情系統連線，隨時掌握狀況與下達各項軍事命令。

而專機隊中編號1911與1912號的BH-1900C行政專機，改裝為EBH-1900航道查核機，負責查核各基地導航設施，螢光橘的塗裝、額外的天線與機腹莢艙為其最大特徵。