一.對後世的影響
1.正面的看法
蒙古帝國在鼎盛時期統治了從東亞到中亞、西亞、東歐的前所未有的巨大帝國。蒙古鐵騎之所到摧毀了許多當地腐朽的統治，促進了歷史的進程。蒙古帝國的建立加速了東西方的文化、技術交流，促進了多民族的融合。整個絲綢之路第一次也是最後一次被只有一個國家控制，這使得東西方的商貿往來比其他戰亂時期要容易得多。在中國，元朝的建立使得長期處於分裂狀態的中國獲得了統一，也為現代中國的版圖奠定了基礎。 元朝的驛站制度，形成了當今郵政的原型。
2.負面的看法
成吉思汗曾夢想讓「藍天之下都成為蒙古人的牧場」。在蒙古帝國的擴張中，多個城池被夷為平地。在西亞，自巴比倫時期建立的農田灌溉系統被徹底破壞，大量良田成為荒蕪。在中國，繁華的宋朝被消滅，經濟、文化停滯不前甚至倒退。在花剌子模舊都玉龍傑赤、巴格達、佩斯等許多城市，蒙古軍隊屠城，大量殺死當地百姓，有的城市甚至被多次屠城，極大地破壞了當地的生產力。蒙古人建立的元朝在中國並未促進民族融和，相反地，蒙古統治者把人民分為四等，激化了民族矛盾，直接導致了元朝的覆滅。
3.蒙古帝國和黑死病
通常認為，1346年，在蒙古軍隊進攻黑海港口城市卡法（又譯克法，現烏克蘭城市費奧多西亞）時，用拋石機將患鼠疫而死的人的屍體拋進城內，這是人類歷史上第一次細菌戰。鼠疫原產中亞，其攜帶者是土撥鼠。在蒙古帝國之前鼠疫曾多次傳入中國，所以雖然中國也曾發生過地區性鼠疫傳染，但中國人也逐漸有了對鼠疫的免疫力，而歐洲人則在此之前從未接觸過鼠疫。在卡法的一個熱那亞商人將帶病的跳蚤無意間帶到義大利，於是鼠疫在歐洲廣泛傳播，成為令人聞之色變的「黑死病」，因為鼠疫患者皮下淤血、全身發黑而死。也有一種說法認為鼠疫是絲綢之路上的商人把病菌帶到中東，然後又傳播到歐洲的。
黑死病使得中世紀的歐洲失去三分之一的人口，對人的關心的人文主義隨之覺醒。歐洲人文主義文學的第一部代表作《十日談》就是薄伽丘在黑死病泛濫最猖獗的時期寫成的，描述1348年發生在義大利的可怕瘟疫。歐洲就此迎來了文藝復興的曙光。
二.對各國的影響
1.在歐洲，由於蒙古鐵騎連下數城，佔領多個國家，歐洲君主十分恐慌。後來有了「黃禍」一說泛指所有東亞黃種人帶來的威脅時，常回溯用於蒙古帝國時期。
蒙古人在中、西亞的征伐迫使奧斯曼突厥人西遷至小亞細亞半島,並在該地建立奧斯曼土耳其帝國。1453年，奧斯曼蘇丹攻佔君士坦丁堡。之後奧斯曼土耳其帝國佔領了歐洲東南部和北非。這是現在在一些如阿爾巴尼亞、波赫等歐洲國家有大量穆斯林人口的原因。奧斯曼土耳其帝國在第一次世界大戰之後解體，其中一部分形成現在的土耳其。
蒙古帝國橫跨東、中、西亞和東歐巨大的疆域。在蒙古四大汗國衰敗之後，前欽察汗國屬國的俄羅斯崛起並佔領了從前蒙古帝國中的大部。今天，世界上最大的國家俄羅斯的形成有明顯的當年的蒙古帝國的因素。克柳切夫斯基和他的學生認為俄羅斯的統一，蒙古至少有一半功勞。另一位歐亞主義哲學家特魯別茨科伊在他的經典著作〈論俄羅斯文化中的圖蘭成份〉指出莫斯科要感謝蒙古統治，俄羅斯在佔領喀山與阿斯特拉罕後才成為強國。俄羅斯的貴族布20%曾與蒙古人通婚，俄羅斯政府的制度也是蒙古式的。從本質上說，俄羅斯是一個東正教蒙古國家。俄羅斯人的日常生活深受蒙古影響，有大量蒙古語借字，郵政，稅收，衣服也受蒙古影響。俄羅斯人也被圖蘭化。
2.在朝鮮半島，高麗王朝被蒙古帝國征服之後歸依蒙古。蒙古帝國在中國（元朝）被明朝推翻後，親蒙古的高麗國王派大將李成桂征明。親明的李成桂從鴨綠江邊回兵，推翻高麗，建立李氏朝鮮。
三.其他影響
蒙古族在每年那達慕大會慶典上，聚集數十樂師合彈奏馬頭琴、鼓、鑼、笛樂器隨西征傳至歐洲，為16世紀起至今古典樂交響樂團起源。有學者發現，多達8%的男性人類是成吉思汗的直系後代。

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