這種工業化的大型集約式/密集型牲畜養殖農場同近年來的一些疫情發生都有關。這種飼養方式使用高密度的養殖，很多牲畜或者家禽生活在擁擠不堪的水泥地上，都在室內，空氣窒息，不衛生，沒有陽光和自然光線，動物終年不見天日，呼吸不到新鮮空氣。這種集約式的飼養方法，不僅對動物十分殘忍不人道，現在人們也開始發現對人的健康也會造成潛在威脅。這些不人道、違反動物最基本天性的飼養繁育做法，與疾病和病毒的滋生和蔓延都有關，是致病細菌生長的溫床。由於大量動物被放在一起生活，擁擠不堪，條件很差，糞便得不到適當清除，為細菌和病毒的傳播帶來了最佳機會，因為病毒和疾病最主要的傳播媒介是通過糞便傳播。 

很顯然，即使你我不是獸醫或者醫學科學家，一些基本的常識和道理也是懂的。由於工業化的集約式牲畜農場把大量動物集中在一起使用工業化流水線般的飼養，這就給細菌的繁殖和生長提供了良好的條件。擁擠的環境會降低動物的免疫力，易患疾病；光線和新鮮空氣的不足則會加速病原體的傳播。為了防止動物生病和互相傳染，飼養人員給動物從一出生就開始使用各類抗生素。後來人們又偶然發現給動物服用抗生素可以加快其生長，因此人們就開始把抗生素作為飼料添加劑的方法成為了飼養場的通用手段。科學證據表明，越多的使用抗生素，尤其是長期低劑量的使用，會導致耐抗生素微生物的增多。而細菌和病毒這些微生物可以把抗藥性基因片段傳播到其他物種之中。在一些病原體中，抗藥性的產生甚至會導致病原體毒性的增加。

例如，一個農業化農場動物食品生產委員會Pew Commission on Industrial Farm Animal Production 2008年發佈的一份報告指出，隨著動物產品在世界範圍內的廣泛食用，新型傳染性疾病的發病率也隨之升高了。其中尤其值得關注的是耐抗生素微生物的大量出現。大家知道，近年來，人的抗藥性問題也日益嚴重。導致動物耐抗生素的原因是集約式工業化農場，普遍把抗生素作為飼料添加劑使用。科學家、醫學工作者和公共健康官員早已對這些問題提出過警告。其中，世界衛生組織（WHO）和聯合國糧農組織（FAO）建議限制給牲畜家禽的抗生素的使用；美國公共衛生協會也在2003年提議中止工業化農場的運營。多達350個專業組織呼籲加強對家畜使用抗生素的管理。美國傳染性疾病協會已經把耐抗生素傳染病作為一種流行病看待。

英國媒體曾經發表文章，比較集約式養殖方法和普通自然養殖牲畜家禽的不同：

乳牛 

自然壽命：２０年 

集約式養殖的壽命：５至６年，死前大都因生產小牛及牛奶而耗盡體力。只有百分之二十五可活至七歲。 自然食物：青草，天然草本植物 

集約式養殖場食物：青草，窖藏秣草，草餅，糞便，回收的牛糞便，被污染的羊內臟及下腳料。 

自然生存環境：草原 

集約式養殖場生存環境：大多在條縫地板的水泥地上在室內渡過 

自然生活行為：吃草，睡覺及反芻 

集約式養殖場中生活行為：因無法反芻導致精神壓抑而啃咬柵欄。受乳腺炎及跛瘸之苦。

雞 

自然壽命：７年 

集約式養殖壽命：對於產蛋雞的雄性雛雞只有一天的壽命，它們因為不好吃而被碾死。肉雞則有六周壽命。 

自然食物：多種穀物，蟲子 

集約式養殖場食物：高脂肪飼料，抗生素及荷爾蒙使其加速增肥 

自然生存環境：在半野外啄食 

集約式養殖場生存環境：雞終日生活在昏暗的雞棚裏，其擁擠程度相當於把一隻鸚鵡塞進一個玻璃果醬瓶之中。 

自然生活行為：自由自在的啄食，塵土浴 

集約式養殖場中生活行為：無法伸展翅膀，沒有空間作巢，無法啄食。由於飽受壓抑會相互啄取羽毛甚至自相殘殺。因此它們的喙都被去除。

豬 

自然壽命：１５年 

集約式養殖壽命：５至６個月。 

自然食物：雜食，以豬鼻子拱食根及塊莖 

集約式養殖場食物：丸狀飼料 

自然生存環境：森林邊緣。野豬會作一米高的窩生小豬。 

集約式養殖場生存環境：大多數的豬從未見過樹和草，在小的無法轉身的有金屬欄杆的豬欄中生小豬。 

自然生活行為：挖掘食物，保持乾淨 

集約式養殖場中的生活行為：精神壓抑使得它們變髒，互相咬尾巴或同類相殘來發洩無法掘土取食的挫折感，具有進攻性，好打鬥。

所以，違反動物基本天性的集約式養殖生產出來的廉價肉蛋，其給人類的代價也許將遠遠不是金錢能計算出來的。