1926年1月1日，國民黨二大在廣州召開，宣佈將西山會議派成員開除黨籍；令人矚目的是，二大會議代表中共產黨員已經占了1/4強；而據稱涉嫌謀殺廖仲愷的胡漢民，雖然人在莫斯科，卻以最高票數當選中央執行委員，令汪精衛、蔣介石相形失色；蔣介石在二大上終於成為中執委常委兼國民革命軍軍事總監；

蔣辭去第一軍軍長職，由何應欽接任，並新成立第14師、20師，使得第一軍壯大為五個師：

第1師：王柏齡；

第2師：王懋功；

第3師：譚曙卿；

第14師：馮軼裴；

第20師：錢大鈞。

1月3日，駐守山海關的原郭松齡部第5軍軍長魏益三率所部三個旅1.5萬人通電投誠馮玉祥，被馮任命為國民軍第四軍軍長；

1月18日，直魯聯軍第20師師長方振武在魯西肥城通電投誠馮玉祥，其部被馮改編為國民軍第五軍；

馮玉祥通電下野，是為了讓吳佩孚轉而收容國民軍一起反奉，然而，吳佩孚下定決心，“國民軍全體繳械投降，是和平的唯一條件”；

1月26日，吳軍北上進攻河南；國民軍第一軍軍長張之江、第二軍軍長岳維峻、第三軍軍長孫岳相繼通電討伐吳佩孚；在華北的國民軍第二軍紛紛南返阻擊吳軍；

國民黨二大結束後，鮑羅廷歸國述職，由最高軍事顧問季山嘉代理其職務；而季山嘉立刻與蔣介石就是否立刻展開北伐發生激烈碰撞。

蔣介石主張趁國民軍在北方吸引直奉兩系軍閥主力之機，立刻揮師北伐；季山嘉則認為國民革命軍各方面條件尚不成熟，還沒有完全被共產黨控制，此時北伐，對於共產黨未必是好事。

此後，季山嘉開始拉攏廣州衛戍司令兼第2師師長王懋功；

1月26日，汪精衛、譚延闿等訪問廣西，李宗仁在梧州盛大歡迎；雙方就兩廣統一在國民政府領導下達成一致；隨後，黃紹竑、白崇禧先後前往廣州，就兩廣統一的各項問題進行會商。

1926年2月，奉軍大舉入關，李景林、張宗昌直魯聯軍在確信孫傳芳不會進攻山東後，也沿津浦路大舉北上；

2月7日，蔣介石發現季山嘉批核的第一軍軍費27萬元，其中王懋功第2師獨佔12萬元；而季山嘉又勸蔣介石前往海參崴，去那裡訓練軍隊，然後進攻東北與國民軍相呼應；

2月9日，蔣介石向汪精衛請辭本兼各職，表示他與季山嘉之間，汪精衛只能選擇一人；汪精衛撫慰之。

2月12日，直系大將靳雲鶚率所部三個師攻入豫東，國民軍米振標、郭振才等相繼請降；

2月14日，湖北督軍蕭耀南病逝，吳佩孚令25師師長陳嘉謨繼任；

2月26日，蔣介石命第2師副師長劉峙將王懋功拘捕，隨即押赴上海，劉峙晉升該師師長；

2月27日，靳雲鶚攻佔開封；同日，國民軍在豫南駐馬店遭到重創，吳軍隨即沿京漢線北上直逼鄭州；

岳維峻部此時驚慌失措，有的準備撤往陝西，有的準備北退直隸，3月1日，岳維峻率第二軍主力西撤陝西，然吳佩孚已令劉鎮華搶佔潼關、函穀關，斷絕國民軍西撤之路；至3月6日，靳雲鶚、寇英傑、劉鎮華三路大軍在三門峽至靈寶地區將岳維峻7萬餘眾包圍，國民軍遺屍遍野，餘者悉數被繳械；岳維峻竄入山西，被閻錫山逮捕，僅李雲龍化妝逃脫，潛返西安；

3月5日，閻錫山東進佔領石家莊，自河南北撤的國民軍遭晉軍截擊，最終，除弓富魁率一個旅突圍與第一軍會合，其餘三萬餘人悉數被北上的直軍包圍繳械；

3月18日，奉軍攻佔灤州；