選擇何種重建方式，將牽動未來的財務結構與節稅空間。多數都更案採「協議合建」，分配彈性高、程序相對簡便；「權利變換」流程繁瑣，須經都更審議與公聽會等多道程序，但可享較多的法定保障與稅賦減免。

根據《都市更新條例》第67條規定，地主向建商過戶領回更新後的新屋，若是採「協議合建」方式，可減徵土地增值稅40%及契稅40%；反之，若是採「權利變換」，則土地增值稅及契稅則享有100%免徵優惠。

共同持有時，伴隨繼承人失聯、家庭糾紛等不確定性風險，建議地主可透過預立遺囑並指定執行人，藉此解決相關繼承糾紛與爭議。