嘉義驛設站於西元1901年4月，最早的車站僅是一座木造站房。1933年第二代鋼筋混凝土站房完工啟用，是西部幹線上鋼筋混凝土站房。在二次大戰期間，站房遭受空襲部份結構受損，直到1949年才又修復完成至今，也是台鐵車站中少數僅存的老站房之一。

從車站外觀來看，由五個圓拱窗所構成的車站大廳，將車站整個氣勢襯托出來，以極簡的山牆立面與簡單的裝飾，構成車站門面，對稱式的建築，讓車站感覺四平八穩。

目前之車站外觀，被後來增建之採光迴廊所阻擋，新舊建築之間總感覺有些許隔閡與不搭調，尤其是車站整個正面，硬生生被迴廊阻礙視覺。

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進到車站大廳，可以看見原始建築的原貌，像是柱子柱頭的雕花，或是樑上的幾何圖形，就連天花板也是格狀裝飾。大廳右側是候車室，這裡最特殊的是樑上的粉紅壁飾，上頭有白色小花與枝葉裝飾，這是一般公共場所難發現的裝飾。

早期的嘉義車站還是三鐵共構，包含通往蒜頭糖廠、北港的糖鐵(現今嘉義後站)，以及通往阿里山的森林鐵路，目前除森林鐵路仍在營運外，糖鐵已經拆除。車站設有一、二月台，一月台為岸式月台，北端則為森林鐵路搭車月台，第二月台為島式月台。嘉義車站往北為嘉北車站，往南則為水上車站，在嘉北車站尚未設立前，嘉義與民雄間站距有9.3K，一度成為西部幹線間最長距離的站距。

1992年嘉義車站設立後站，透過站外天橋（或站內地下道）可以來到後站。最早的站外天橋僅是一座沒有屋頂的走廊，2011年配合後站客運轉運中心設立，將站外天橋整建，並加設鋼骨結構，除舖設帆布屋頂，另增建電梯、手扶梯，讓往來行人更為便利。在鄰近轉運中心的橋段，還設立「檜木心鎖橋」，讓大家可以寫上心願並鎖在橋上。

嘉義後站與客運轉運中心共構，後站僅除了台鐵售票窗口外，對側還有國道客運售票窗口，兩處場站感覺已經融合為一體。不過仔細觀看還是能區分出來後站與轉運中心，原本的後站出入口，則已經變成客運月台，周邊增建建築就是轉運中心。