自來水的供水系統，輸送管線的維修以及家家戶戶都有的私有儲水塔的管理問題實在是難以克服的問題，自來水公司並非將原水經淨水處理完成，送出淨水場之後，就責任已了，漫長的輸水管線加入的污染，甚至屬於用戶私人財產的儲水塔的污染都還得納入考量。

至於如是做法確實可以去除令人不悅的消毒水味道，但由於臭氧的高度不穩定性質，因此其有效時間甚短。由於台灣供水穩定性不高，導致家家戶戶設置儲水塔儲水的用水型態情況下，以臭氧殺菌的方式是不可行的。以臭氧殺菌的先決條件是，淨水場與末端用戶的關係必須是屬於社區型的短距供水，亦即水送出去之後必須在短時間之內完全去化，否則菌的滋生在所難免。如今水公司告訴我們的高級淨水處理若真的以為沒了消毒水味道就是「高級」，那麼就真的是自欺欺人了，只能當作是另一個台灣政壇的鋸箭之舉。