科學家已發現攝取牛奶和人類許多健康上的問題有關，以下是其中的一些問題：
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● 新生兒在第一年內若餵食全脂牛奶可能會有缺鐵的風險。事實上，許多有關當局，包括美國小兒科營養委員會建議，新生兒在第一年應該將牛奶排除在飲食之外。對嬰兒來說，牛奶內的鐵質不容易吸收，此外，牛奶會妨礙人體吸收來自其他食物的鐵質。
● 胰島素依賴型糖尿病（第一型或年幼型糖尿病）和乳製品有關。不同國家的流行病學研究指出，食用乳製品和胰島素依賴型糖尿病的發病率兩者之間有強烈的關係。
● 牛奶是最常見的食物過敏原之一，而且也是引起嬰兒過敏最常見的原因。有些人的體質會將牛奶蛋白視為外來的蛋白質。全球有超過百分之七十的成人無法消化乳糖。
● 牛奶是培養和傳播許多細菌與微生物一個絕佳的媒介。最耐高溫的病原體──伯納特科克斯氏體（引發Q熱病）和結核分支桿菌（引發結核病），，可能存在於生牛奶中。
●單核細胞增多性李斯特菌是一種存在於軟質乳酪的細菌，它可能會導致非常嚴重的疾病，包括腦膜炎及敗血病。受到李氏桿菌感染的死亡率高達百分之三十，其中最容易受到感染的族群為孕婦、嬰兒、老年人和免疫功能不全的人。
