根據一項腸腔影響胜肽吸收的研究發現，二胜肽與游離胺基酸很類似，皆有游離羧基和胺基具有相同質子效果，二胜肽並不會因為酸性pH值發生質子化，當pH從中性變為酸性時，二胜肽與游離胺基酸即呈現單價陽離子型態，會降低載體系統的交互作用，從質子的變化可以看出，游離胺基酸會比二胜肽多出許多質子化(protonation)，但是胜肽連結的胺基酸並不會發生質子化，在酸性環境穩定度較高。