2008年1月，李遠哲選舉前夕，故技重演，跑出來危言聳聽說：『總統選舉如果國民黨再度獲勝，台灣的政治「將陷入很 危險的狀態」』，希望再扮演2000年台灣總統選舉臨門一腳角色。

當時台彎多數選民，已將李遠哲的話當屁，豈會聞臭而逐，被他牽著鼻子走，最終仍將票投給馬英九，選舉結果，國民黨的馬英九大勝民進黨謝長廷180萬票，當上中華民國第十二任國家元首。

馬英九執政後，四年下來，台灣安然度過全球金融海嘯，兩岸關係更加和平融洽，外交友邦更穩固，台灣並沒有如李遠哲所言「國民黨再度獲勝陷入很危險的狀態」，首任屆滿，連任之路，仍獲得多數選民信任，贏得選舉，以過半數票連任成功。人民再度以選票，重重打了信口開河的李遠哲嘴一巴掌。

台灣是否會陷入很危險？李遠哲並非是以客觀角度去分析與表態，而是以個人的政黨傾向來做假設與推斷，總是在緊要關頭，跳出來表態在說三道四，想左右別人，影響局勢。

 當民進黨政時，核四停建再續建，一樣追加核四工程預算款，當時反核人士相當不諒解，2008年總統大選前，李遠哲為了說服反核人士支持民進黨候選人，又跳出來為核四續建背書，報載在二○○八年二月十八日「錢思亮先生百歲冥誕紀念會」上，他對未來新總統能源政策的建言重點有三:

一. 台灣每人每年的二氧化碳排放量是居世界第三位，是很壞的榜樣。要解決二氧化碳排放問題，可以重新思考接受核能。

二. 科技進步，核能安全已不嚴重，只要做好核廢料處置即可。五十年內，台灣不可能做到非核家園，核四一定要建。

三. 核一、二、三要延後除役；等到五十年後，再生能源太陽能技術成熟，甚至達到核聚變（核融合）的境界，核能電廠才能除役。他在說這些話前，已與林義雄達成共識，暫緩非核家園五十年。

當時的李遠哲對核四續建運轉認知上，是安全、沒危險的，做好核廢料處置，也是有能力沒問題的，他才敢強調說『核四一定要建』，更有辦法去說服林義雄達成共識，暫緩非核家園五十年，而非蔡英文所主張的25年。

日本311大地震福島事件後，長達兩年來，未有聽李遠哲出來改口說，他不再贊成核四續建，當蔡英文選總統時，提出『核四續建不商轉』，也未見他出來說，蔡英文主張核四要續建，是不對的。可見福島事件後，核四的續建，李遠哲是不反對且無意見的，似乎仍維持他所說，『核四一定要建』的態度與主張。

然而民進黨為了明年7合一大選暖身，又燃起反核大火，社會上反核浪聲高漲今日，他又見風轉舵，改口說他不贊成核四續建，且主張核一、二、三如期除役，並為昨是今非在道歉，但並未對核四停建後，台灣將如何做到節能減碳，有何隻字片語交代。

清楚顯然，李遠哲的危險說是建立在顏色基楚上，逢綠則不危險，逢藍則危險，對黨不對事。政治議題上，態度如此，核能能源政策議題上，也是一樣，隨著顏色在搖擺，並非客觀在就事論事。

假如今天是民進黨繼續執政，在可能增加排碳量下，污染空氣，暖化地球，他是否會出來喊停建核四?實叫人打個問號?

李遠哲：藍贏總統大選 台灣瀕危 自由時報2008年1月23日

〔駐日特派員張茂森／東京二十二日報導〕前中研院院長李遠哲接受日本「產經新聞」專訪時指出，三月的總統選舉如果國民黨再度獲勝，台灣的政治「將陷入很危險的狀態」，、、、、