強力反對基改作物之理由:

1. 具抗藥性的基改作物,讓作物使用更多農藥與殺草劑,危害人畜健康.

2. 具殺蟲毒蛋白的基改作物嚴重威脅昆蟲,蜜蜂,鳥類的生存，引發食物態鏈的大災難。

蜜蜂消失最多在美國,使用最多的GMF

3. 可能衍生出具抗殺蟲蛋白能力害蟲及對除草劑具免疫的超級野草,造成生態浩劫.

4. 基因改造食品可能會有影響人體健康潛在風險及產生新的毒素或過敏源。

5. 農作物品種由數量繁多,快速消少,造成種子公司壟斷種子市場.農民無法自行育種,付費購買種子,不小心吃上官司..

當基因約90%的植物消失了,原有數百種大豆品種…最後能只剩幾十種

若我們餘下的食物品種少，萬一出現病毒、害蟲，或會大規模消滅這類食物！

農民田間有因自然散播而產生的基改作物，而被跨國公司控告、遭到起訴。

6. 侵害消費者知的權利.

一旦基因改造農作物可作商業化種植，種子價格必然隨即上漲，農民生產成本增加，最終導致糧食價格不斷攀升，而窮人也無法負擔昂貴的糧食。所以，通過基因工程解決飢餓問題，結果只會自相矛盾。既然如此，基因改造食物當然也不能解決飢餓問題。 

現時有很多國家(如大都份歐洲國家)是禁止有GMO成份的食物進口的。  韓國、日本、澳洲、紐西籣都不淮許美國有GMO成份的食物入口，甚至如牛隻所吃的穀類有GMO成份亦不可入口。