建議書指出，學研單位缺乏市場導向的創新研究，產業界缺乏所需的關鍵技術問題，在面板跟半導體產業尤甚；未來應加強「問題導向」研究，包括由國科會整理台灣產業需求、訂題目徵求學研界投入。

「高等教育與科技政策建議書」由中研院院長翁啟惠主導，邀集中研院院士、國內外學者、大學校長及產業界等60多位代表參與。業界代表包括廣達電董事長林百里、宏碁集團創辦人施振榮、台積電董事長張忠謀、央行總裁彭淮南等。

中研院院長翁啟惠表示，台灣的研究計畫多為自由型研究，由研究者自己發想、向國科會申請研究經費，「放牛吃草」，可能與社會、產業脫節；他建議國科會應建立平台與各界討論，依此訂出問題導向研究主題。

翁啟惠指出，國外許多企業會設獎學金或獎座，吸引研發人才；或由政府匯集產業需求後，再對外徵求研究計畫，造就許多卓越研究結果。他舉例，美國曾投入38億 美元徵求全人類基因定序研究計畫，結果產生5000億的效益，創造無數工作機會，並在基因療法、早期檢測、精密儀器、奈米技術等領域都有突破。

建議書提到，公費計畫可擴展至業界，由政府給企業特定員額，或補助部分經費，提供抵稅等誘因，鼓勵業界培育人才。

美國企業 Internship Program 企業實習例子