明鄭時期，又稱東寧國，係指臺灣南部在1661年－1683年間，由南明延平王鄭成功所建立之鄭氏政權統治的時期，歷經鄭成功、鄭經及鄭克塽三世統治22年。東寧為臺灣歷史上第一個漢民族政權，主體民族為閩南人。鄭成功先將臺灣改稱「東都」、再改為「明京」，南明永曆帝遇害後建國，國號「東寧」，赤崁地方更名為東都明京，又設京城承天府於今臺南市以處理軍務。鄭經繼位後，續以東寧為國號。制度上，東寧奉已滅亡的南明正朔之永曆年號、禮遇許多明朝宗室，以大明延平王、招討大元帥的身分、名義號召恢復明朝；但實際上，東寧國是一個獨立行政、以鄭氏王族為最高元首的獨立王國，鄭經也自認東寧非屬於中國領土。

明鄭時期在華文地區名稱包括鄭氏治臺時期、東寧王國（王朝）、延平王國（王朝）、鄭氏王國（王朝）等。現今歐美主要使用東寧王國，如英文 Kingdom of Tungning、西班牙文 Reino de Tungning 等，此用法未知由華文世界或者西方率先使用。此外當時西方人也有稱鄭氏政權為臺灣王國（如英語 Kingdom of Taiwan）、福爾摩沙王國（如英語 Kingdom of Formosa）者。

1644年（明崇禎十七年，清順治元年），李自成攻陷明朝首都北京，建立大順政權；不久，滿族建立的清朝八旗軍又擊敗李自成，定都北京，並繼續向南方進攻。

與此同時，明朝遺臣在南京擁立明宗室福王朱由崧，建立了史稱南明的偏安政權；在清廷欲取代明朝入主中原的態勢明朗後，南明轉而聯合各地的漢族武力抗清，但軍事不利，弘光、隆武、紹武、永曆諸朝廷先後遭清軍消滅。鄭芝龍所部原是隆武朝的主力，主要在福建境內活動；鄭芝龍降清後，鄭成功陸續接收其勢力，繼續在東南沿海武裝抗清。

1658年－1659年間，鄭成功大舉攻打清江寧府（原名南京）失敗，實力大損；迫於形勢，決定奪取時由荷蘭東印度公司支配的大員以供部隊給養。

鄭成功

1661年（明永曆十五年正月），鄭成功在金門誓師；他親率將士25000名、戰船數百艘，自金門料羅灣出發，次月抵澎湖，四月初二日（4月30日）抵鹿耳門。並利用漲潮出敵不意地在鹿耳門及禾寮港登陸。以優勢兵力包圍荷軍防守薄弱的普羅民遮城，並切斷荷軍水陸交通，不久，普羅民遮城守將貓難實叮（Jacobus Valentijn）獻城投降。

四月初七日，鄭成功親率大軍對防禦堅固的荷蘭首府熱蘭遮城進行攻打。經派楊朝棟諭揆一投降無效後，即調集火砲朝城堡砲轟，然而在從大員市鎮朝城堡進攻時，卻遭荷軍居高臨下擊退。之後鄭軍即採取長期圍困，同時將多數部隊派往各地囤墾以解決糧食不足的問題。五月二十八日，荷蘭東印度公司得知台灣戰況後，決定派七百人、戰艦十艘赴台。七月初五日抵達。之後雙方稍有接觸，但均無較大戰事。至八月二十三日（9月16日），雙方再度海戰，鄭軍經一小時激戰，擊毀荷艦二艘、俘小艇三艘、殺敵百餘人，其餘荷艦逃往遠海。

閏十月，荷軍發動作最後一次攻擊，但仍寡不敵眾，之後又有日爾曼傭兵逃脫向鄭成功說明堡內荷軍士氣低落，並指出欲取熱蘭遮城，必先取其衛星碉堡烏特勒支碉堡（位在今安平第一公墓），奪取該碉堡則可居高臨下砲擊熱蘭遮城最脆弱的四角附城。鄭成功遂於該月著手準備攻城計畫。

十二月初六日（1662年1月25日）鄭軍於鯤鯓半島發動總攻擊，以大砲不停轟炸，當日即發出2,500發砲彈，其中1,700發左右打向烏特勒支碉堡，幾乎將之夷為平地，荷蘭守軍被迫自行炸毀碉堡殘餘部分後撤退。此役徹底瓦解了熱蘭遮城內守軍的士氣，兩天後大員評議會決定議和談判。

大員長官揆一於同年十二月十三日（1662年2月1日）簽字於締和條約投降，至此，台灣台江領地，盡落明鄭之手。

鄭成功建國後，下令屯墾台灣，北至噶瑪蘭、南至瑯嶠。然而，大肚王國與瑯嶠的反抗，鄭成功實際上的統治區域大約是從二林至茄藤的範圍之間。1662年，王世子鄭經與幼弟的乳母陳氏通姦，鄭成功勃然大怒，下令人在廈門的鄭泰斬殺世子，鄭泰因不忍而違抗王命。1662年6月23日，罹患瘧疾(來源請求)的鄭成功於盛怒之下薨逝，年38。死時吩咐弟鄭襲要輔佐兒子統治東寧。

1681年(永曆三十五年)四月鄭克塽追諡其祖父為諡號「潮武王」。鄭成功從攻克台灣到逝世為止，僅僅統治台灣1年又數月。

1662年（永曆十六年）6月，延平王鄭成功薨逝。黃昭、蕭拱宸等人以鄭經得罪先王不得繼位為由，於安平擁立鄭襲（鄭成功之六弟）為國主，將軍馬信、黃安不從。賞勳司蔡政奉鄭成功之袍入廈門，洪旭等人遂擁鄭經為王。同年11月，鄭經命周全斌為五軍戎政，親率陳永華、馮錫範等人入鹿耳門。右虎衛黃安聞訊後，率師前來會合，進王城誅殺黃昭、蕭拱宸等人。事後，鄭襲遭鄭經押回廈門軟禁。

嗣位之爭結束後，鄭經繼位。1663年初，鄭經以洪旭守廈門、鄭泰守金門。鄭經聽說鄭泰與之前擁立鄭襲為王的黃昭有書信往來，便懷疑他亦參與逆謀，因此欲召見他，鄭泰卻稱病不見。參軍陳永華以鄭經將回東寧為由，委任鄭泰為「居守戶官」，鑄印送至金門並邀鄭泰入廈門餞行。7月10日，鄭泰率兵船赴宴，被鄭經扣留軟禁，船艦皆為周全斌所併，只有蔡璋逃回金門。鄭泰之弟鄭鳴駿與子鄭纘緒率部屬及家眷入泉州投降清朝。鄭泰聞訊後自縊。鄭泰死後，鄭經鞏固了自己的王權。

1663年11月18日（永曆十七年十月十九日），清朝與荷蘭組成聯軍進攻廈門、金門，鄭軍不敵，退往銅山。戰後軍心不穩，大將周全斌降清，鄭經只好退回台灣。1665年，清荷聯軍繼續進攻澎湖，遭遇颱風、無功而返，清朝於是放棄了攻佔台灣的企圖，轉而與鄭經談判。清朝的立即威脅解除後，鄭經開始強化對台灣的統治力，鄭經於1666年率兵進攻駐守雞籠的荷蘭軍隊，雖未成功佔領，但荷蘭方面認為雞籠難以防守，1668年棄守雞籠，亦從此放棄台灣。1667年7月，鄭經與清朝展開第一次談判，鄭經聲稱台灣「非屬版圖之中」、「東連日本，南蹴呂宋，人民輻輳，商賈流通。王侯之貴，固吾所自有，萬世之基已立於不拔」；於1669年的和談中，派遣柯平、葉亨赴泉州與清廷議和。鄭經再度強調鄭氏佔領台灣是「建國東寧」、「於版圖疆域之外，別立乾坤」，然而兩次的談判鄭經皆以不接受薙髮拒絕清朝，並用箕子朝鮮作比喻，談判最終破局。

對台灣的統治能力日漸鞏固後，鄭經試圖以貿易來提升東寧的國力。除了與清朝進行走私貿易外，日本的德川幕府也是東寧國的重要貿易夥伴，東寧大量進口日本的銀、銅等金屬與盔甲，以武裝自己的軍隊，雙方貿易於1665至1672年達到高峰，鄭經更允許日本商人居於雞籠，以促進東寧與日本的貿易交流。日人以「東寧國王」稱呼。鄭經亦於1672年邀請英國東印度公司來到東寧國，並與之簽訂通商條約，出口糖與鹿皮並進口西洋槍砲以增強東寧軍隊的戰鬥力，另外更請求英國人訓練砲兵，戰爭時更借用英國砲兵手作戰。

1673年，清朝平西王吳三桂起兵反清，史稱三藩之亂。1674年4月21日，清朝靖南王耿精忠起兵響應，隔海邀請鄭經加入，鄭經允之西征。鄭經渡海後，要求耿精忠將漳州與泉州交給自己，但佔領整個福建的耿精忠卻拒絕之，鄭經遂出兵佔領海澄與同安，雙方開始交惡。然而，泉州、漳州以及潮州陸續投靠鄭經，耿精忠見情勢不對便出兵進攻泉州，但卻被東寧將軍劉國軒擊退，雙方接著又持續相互進攻、戰鬥。1675年，耿精忠與鄭經談判，雙方以楓亭為界，北屬耿氏、南屬鄭氏，平息戰鬥。1676年，鄭經擊敗平南王尚之信，迫使尚之信加入反清行列，鄭經隨後佔領惠州。由於鄭經於擁有漳州、泉州、潮州、惠州等四座首府後，又攻下汀州，因此與耿精忠的聯盟再度破裂，腹背受敵的耿精忠只好降清。耿精忠降清後，獨自面對清朝軍隊的鄭經節節敗退，最後只好退回廈門。

1677年退回廈門後，清朝再度與鄭經展開和談，清朝康親王傑書向鄭經許諾鄭經若從中國沿海的島嶼撤退，就答應比照朝鮮讓東寧成為清朝藩屬並與東寧通商、永無猜嫌。1678年的和談中，清朝將領賴塔給鄭經的書信中聲稱，如果鄭軍肯退守台灣，則「本朝何惜海外一彈丸之地」，鄭氏可永據台灣，清廷當成朝鮮、日本，不必剃髮易衣冠、稱臣納貢可也不可。鄭經予以拒絕。

1680年，鄭經從廈門撤守台灣。回台灣後，鄭經意志消沉，移居北園別館，終日飲酒賦詩、棋藝書畫、出外狩獵，將東寧國政全權交予監國世子鄭克臧與諮議參軍陳永華。

1681年3月17日，鄭經因狩獵摔傷不治，薨於北園別館，得年40，統治東寧國近20年。1681年（永曆三十五年）四月剛登基的元子鄭克塽追諡其父王為「潮文王」。

1679年，鄭經西征清朝之際，聽陳永華之請將王子鄭克𡒉立為世子，並授職為監國，號監國世孫。由於其辦事英明果斷，頗有其祖鄭成功之風範，因此人稱東寧賢主，但也因此得罪了王叔鄭聰等人。1680年，鄭經西征無功而返，監國世子繼續執政，並深得父親鄭經之信任，但後來總制陳永華去世，因此監國漸漸在政治上孤立無援。1681年（永曆三十五年），延平王鄭經薨逝。逝世前，於北園別館將監國鄭克𡒉託付給劉國軒。

鄭氏宗親鄭聰等人眼見鄭經已薨，便與馮錫範、劉國軒等人聯手向董太妃進讒言，汙陷鄭克𡒉乃李氏之螟蛉子，董太妃一時不察便下令收回鄭克𡒉之監國印璽。得到董太妃允許後，劉國軒與馮錫範便領兵進入延平王府捉拿監國、囚禁於北園別館，並於當夜遭鄭聰等人刺殺。監國遭刺殺後，原意僅免監國職的董太妃亦無力挽回，遂命監國夫人陳氏將監國之屍送返延平王府、收斂守喪。喪畢，陳氏自縊。自責的董太妃也於同年6月去世。

太妃死後，東寧大權落入外戚馮錫範與劉國軒之手，因此馮錫範立其婿鄭克塽（元子）為王，民心從此渙散，東寧國亦從此一蹶不振。

世子鄭克臧遭弒殺後，太妃亦於6月去世，東寧國的實權落入勇衛馮錫範手中，他於是擁立自己的女婿－元子鄭克塽為王，東寧民心漸漸渙散。1682年9月，鄭氏降將施琅上書清聖祖請求征台，康熙允之。翌年6月，施琅奉康熙詔，進攻澎湖。經過澎湖海戰後，7月中旬，施琅順利擊潰劉國軒所率領的東寧海軍，攻佔澎湖。

澎湖海戰後，鄭克塽於廷上徵眾臣議，朝臣分成死守台灣、遷呂宋島再戰與降清三派。1683年（永曆三十七年）9月，與眾臣商議後，鄭克塽選擇了劉國軒的建議，呈降表予清。鄭克塽降清不久，明朝寧靖王朱術桂便自殺、施琅入台納降。自此，東寧亡國。從1661年（永曆十五年）4月鄭成功入台到鄭克塽1683年（永曆三十七年）9月降清為止，鄭氏計在南台灣經營共23年。

清將領施琅受鄭克塽投降後，台灣正式進入清治時期。清朝消滅東寧後，除了大舉毀滅東寧王朝的文化，更將東寧朝臣們與其親屬大舉遷往清國。其中，鄭氏王族納入上三旗管束；文武官員與士兵則分別遷至在山東、山西及河南諸省墾荒，使台灣失去可能領導反清的人物。至於東寧的大量遺民，清廷則採取以漢治漢的策略，長期以攻台將領擔任台灣軍事首長。如福建水師一職從1684年至1721年計37年間共歷施琅、張旺、吳英、施世驃四任提督，除張旺之外，其他皆是攻台將領，尤其是施琅、施世驃父子共任職達25年之久。在路陸提督方面由萬正色、吳英、藍理皆為攻台將領。

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