吳敦義第一站到訪燕巢陸軍工兵學校探視災民後，前往甲仙鄉參加八八水災滿七超渡法會，吳敦義和縣長楊秋興在祭拜之後，隨即驅車前往六龜鄉新開部落與災民對談，再趕往旗山鎮旗尾地區視察農田漂流木災損及清理復舊情形。

林務局報告指出，莫拉克颱風共造成全台78萬噸的漂流木，全台有114個鄉鎮受災，林務局已完成76個鄉鎮的清運工作，但高屏溪流域仍有8萬餘公噸的漂流木尚未清運完成，預計要到11月底才能清完。

吳敦義聽完簡報並接受民眾陳情後指示，漂流木應加快處理腳步，讓農民能儘速復耕，未來更要加強山坡地造林保育政策，否則山坡地崩塌會再釀巨禍。

指旗山地區淹水嚴重 可全額補助

此外，針對防水閘門的補助問題，吳敦義表示，旗山地區淹水情況嚴重，可比照屏東林邊鄉全額補助方式，由政府出資，對於縣府將針對災區農地進行重劃，吳敦義也表示可由中央和地方一起出力，將農地重劃視為災後重建的一環，幫助農民早日站起來。