有關咖啡的由來其實很多，但其中的一個是，"十六世紀的衣索匹亞有個牧羊人，有天發現自己飼養的羊群，竟然不停的跑來跑去，他覺得奇怪，於是便觀察羊群所吃的食物，才發現是因為紅色的果實，讓他的羊群吃了才會如此的精力旺盛，於是牧羊人便拿著這果實和僧侶分食，每個人吃完之後便精神抖擻，後來該果實則被用來製藥，且頗受醫生好評，經查證此紅色果實即為咖啡豆

據說最早的咖啡樹是在衣索匹亞發現的，但是咖啡最早的發源地，一般都相信是在中東，至於那位扮演發現新大陸角色的哥倫布，是一位年輕的阿拉伯牧羊人。牧羊人在放牧過程中發現羊群吃了一種常綠喬木的果實之後，都會變得興奮異常，於是也好奇地吃了一些果實，沒想到這一試，為往後數百年的人類試出一種魅力無窮的飲料。之後他便拿著該種果實分給修道院的僧侶們吃，所有的人吃完後都覺得神清氣爽，據說此後該果實便被用來作提神藥，而且頗受醫生們的好評。該種果實便是現今的咖啡豆。

咖啡供作飲用，據說是開始於十一世紀初，阿拉伯的古文獻上便可看到該項記錄。在那之前，阿拉伯地區是將咖啡生豆曬乾了再煎煮後當胃藥喝的，但後來得知咖啡還具有提神效果，再加上回教誡律嚴苛，禁止教徒們喝酒，教徒們便用烘培後熬出來的咖啡汁液，作為取代酒類的興奮性飲料飲用，據說當地人懂得烘培生豆來使用，則是十三世紀以後的事。

咖啡在十二、三世紀的時候被阿拉伯人大量有計畫種植，十六世紀中東的大馬士革（1530年）誕生了世界上第一家咖啡館。短短數年間，從古老的君士坦丁堡到高加索，從波斯灣到布達佩斯，再整個帝國的兩百多個城市都擁有不同數量的咖啡鋪，而連接這些城市的穿過沙漠荒野的道路沿途也到處都是可以移動的咖啡帳篷，為絡繹不絕的商旅和軍隊服務。

同一世紀咖啡也傳到了歐洲，當時咖啡隨著土耳其人西征奧地利，被帶往西方國家，沒想到很快就擄獲歐洲人的心。據記載，1596年從威尼斯寄往荷蘭的一包樣品，曾是阿爾卑斯山以北的歐洲人見到最早的咖啡豆。有傳說，因為當時咖啡在西歐十分罕見，最初竟還有德國家庭主婦用雞湯來作咖啡的笑話。據學者推測，在十六世紀末繁榮的調味原料進出口貿易中，有不少來自東方的咖啡豆開始經貿發達的威尼斯源源不斷地進入歐陸。

不過歐洲第一家咖啡館，卻一直到一六八三年才在奧地利維也納，由一個波蘭人開設。以精悍出眾的亞美尼亞商人約翰迪奧達（Johannes Diodato)為首的通曉東歐和土耳其語言的商人，在戰時不光為奧地利均度擔任翻譯和嚮導，而且也在火線兩邊從事獲利驚人的咖啡貿易，在滿足他們自己經營的咖啡館的需要的同時，還為許多貴族和富有市民家庭沙龍的咖啡聚會解決了原料短缺的燃眉之急，深得上層人士的青睬。幾年後，大街小巷隨處都可見到的咖啡業飛速發展，這些咖啡館大都是由他的同鄉，或來自鄂圖曼土耳其帝國其他地區的土耳其人所開設，自然而然地帶有相當濃厚的中東風味，許多街頭拐角飄出咖啡熱香的狹窄的店堂裡，還可以看見伊斯坦堡咖啡鋪裡特有的靠牆的常板凳，敞開燒柴的咖啡爐，裡面的客人也大部分來自附近有市集的攤販、工匠和異鄉謀生的手藝人。嚴格地說還只能算是個小小的簡易咖啡鋪子。

那時，中上層社會的人們還陶醉在自己家裡封閉的私人咖啡圈子裡，熱衷於最初經濟成功的自由市民階級還為成為左右社會政治社會的力量。今天人們所熟悉的，或者想像衷的高雅、舒適、具有開放的社交沙龍氣氛的純歐洲風格的咖啡館，還要等待大約五十年的時間，直到市民意識普遍覺醒的啟蒙主義時代，才真正開始登上維也納和其他西方城市生活的舞台中心。

咖啡的傳說眾說紛紜，其中較讓人津津樂道的有二：一是「牧羊人的故事」稱基督教發現說。記載於黎巴嫩語言學家法斯特.奈洛尼(1613~1707)的「不知睡眠的修道院」(1671)著作中記載的，以十六世紀衣索比亞為背景。十六世紀衣索比亞有一個牧羊人，有一天發現自己的羊在那蹦蹦跳跳地，他覺得不可思議，加以觀察後，發現原來羊群吃了種紅色的果實，於是他便拿該果實給修道院的僧侶們吃，大家吃了後都覺得神清氣爽，據說此後該果實被用來做提神藥，還很受醫生們好評。該果實便是今日的咖啡豆。

另一則是「阿拉伯僧侶」稱伊斯蘭教說。是回教徒阿布達爾.卡迪的「咖啡由來書」(1587)記載的故事，此故事的舞台是十三世紀的耶門山中。一二五八年，因犯罪而被族人驅逐出境的酋長雪克.歐瑪爾，流浪到離家鄉摩卡很遠的瓦薩巴（位於阿拉伯）時，已經饑餓疲倦到再也走不動了，當他坐在樹根上休息時，發現一隻鳥停在枝頭上，以極為悅耳的聲音啼叫著。他仔細一看，原來是啄食了枝頭上的紅色果子，才扯開喉嚨叫出美妙的啼聲，於是他把果子摘下來放在鍋裡熬煮，之後竟發出濃郁的香味，喝下後不但覺得好喝，精神也為之一振。於是他便採下許多神奇果子，遇到病人便熬成湯汁給他們喝，由於他四處行善，族人便也原諒了他，不僅讓他回摩卡，還推崇他為聖者。由以上兩則故事可得知，咖啡始於非洲的衣索比亞。