呂學樟表示，中研院與國安會都是隸屬總統府下的單位，是總統「幕僚」，應提供國家科學發展的建議與提醒，但是，在學運期間卻變成「嗆聲部隊」，對行政倫理、體制規範都是嚴重問題。他指出，中研院近5年員工多了30人，預算增加50多億元，研究績效要讓外界了解，若績效不彰，在檢討組織改造時，可以考慮廢除。

對此，黃國昌下午立刻於臉書上發文回擊，他說在看到友人轉述的媒體報導後，「整個人突然嚇醒」，他說，呂學樟演了這麼一場戲就是為了說出「嗆聲部隊」的談話，在他個人記憶所及，即使是偉大的領袖蔣公，當年都不至於對胡適院長說出這樣的話，簡直令人瞠目結舌，「完全無法理解一個人無知的底限在哪裡？」(新頭殼2014.5.12.)

(耕夫云)

     究竟是誰『無知』呢？

     無論立委呂學樟說了啥，他有表達意見的權利；而你黃國昌當然也

有表達意見的權利。

     在你黃國昌『瞠目結舌』且『完全無法理解一個人無知的底線在那裡』

的同時，本人也對你黃氏的一段話感到同等『瞠目結舌』且『完全無法理解

一個人無知的底線在那裡』！

    你黃氏竟將胡適院長比擬如今的『中研院』？以當年胡適院長的學識、

風骨與對國家民族的重大貢獻，當今的『中研院』豈不汗顏？當今的所謂

『中研院』誰堪比擬？究竟是誰『比較無知』呢？