國際及兩岸教育司長楊敏玲表示，根據初步清查結果，中華、中原、朝陽科大、靜宜、世新、清大6所學校都有簽署承諾書，但是都沒有向教育部申報，違反《兩岸人民關係條例》，在未來2周之內會繼續調查其他各校有無類似情事，楊敏玲說，等到調查結果出爐後會和陸委會一起審查，並強調教育部非常歡迎兩岸進行學術交流，但是過程必須合法，程序也不能有缺失。

世新大學被爆出與中國學術單位簽署「研修承諾書」，承諾陸生台台期間上課內容不涉及任何政治敏感活動，也不會出現有關「一中一台」、「兩個中國」、「台灣獨立」等方面活動，被外界批評是違反言論自由，教育部長潘文忠說，該承諾書已經涉及政治性，明顯違反《兩岸人民關係條例》，教育會於1周內進行清查，最重可開罰新台幣50萬元，並限期改善。