從鐽震案到巴紐案，民進黨政府出紕漏一次比一次嚴重，全部發生在不受監督的國安體系裡。東西方政府莫不高舉國家安全大旗，堵攸攸眾口。但講究隱密的國家安全體系，居然是台灣政府弊端最多、最不安全的地方，真是最大諷刺。
總統府、外交部、國防部是台灣國家安全體系的三大支柱，行事作風也是最不受國會民意監督的。從時間序列上觀察，假造單據報銷公款的國務機要費案爆發後，絲毫沒有讓民進黨政府的高層官員，對於不循正常程序的行事風格多所節制，不但編出個南線專案做煙霧彈，另一方面又大搞巴布亞紐幾內亞建交案，讓外交掮客騙走政府3000萬美金。
邱義仁所託非人，把台灣與巴紐建交案搞砸鍋，居然同時還能跳過行政院長張俊雄，指示軍方配合成立民間軍火公司，獨攬軍品交易生意，一錯再錯。民進黨政府能夠接連犯錯，不受節制，就是因為過去國民黨執政時，為了一黨之私，故意在政治制度的設計上，允許國安體系保持隱密，不受民意監督，政府預算、決算審查，都只是聊備一格，徒具形式，如今讓台灣蒙受重大損害，朝野都難辭其咎。
政黨輪替無法保證政府弊端從此消失，為今之計，只有趕快修法，明文規定外交預算不能再拿糊塗帳給立法院審查，違法使用預算的官員必須嚴懲，審計部審查政府決算未詳實，也應加入罪責，徹底消除官官相護的惡質風氣，政府才無法再以國家安全的理由，遮掩政府貪瀆的事實。
