財政部表示，營利事業給付員工的醫藥補助費，應併入員工薪資所得課徵所得稅。

財政部說，企業給付員工的醫藥補助費，屬於所得稅法第14條第1項第3類規定薪資所得中的各種補助費之一，須併入員工薪資所得申報，課徵所得稅。

不過，員工如因遭受職業災害，醫療期間無法工作，或經醫院診斷審定為喪失原有工作能力，雇主依勞動基準法規定給付的補償金，則屬損害賠償性質，員工取得補償金依法可以免稅。