一般人都認為細菌有害，總欲除之而後快。但有理論認為，現代人越來越常見過敏疾病，可能即因環境衛生改善，接觸病菌少，免疫系統不當發展所致。因此，吃細菌來調節免疫力，已成為改善過敏問題的新方向。

中國醫藥學院附設小兒主任，過敏免疫風濕科專家許清祥指出，過去二十年間、包括氣喘、過敏性鼻炎、異為性皮膚炎等過敏性疾病，患者增加五倍以上，估計三分之一人口為其所擾。其原因有人認為是環境汙染、過敏原增多，也有一派理論認為，這是因為公共衛生水準提高，減少接觸病原所致。

許清祥醫生表示，位居人體免疫系統中樞的T淋巴細胞可分為兩型，第一型T細胞主要泌干擾素，對抗細菌、病毒，第二型T細胞則分泌細胞間白素，進而產生IgE抗體，對抗寄生蟲，而生IgE越多，過敏反應越強烈。這兩型細胞在體內具有動態的平衡關係，一型增多，另一型相對減少。

許清祥醫生分析，公共衛生改善、各種免疫發明後，現代人的免疫系統對抗細菌、病毒的機會遠較以前少，第一型T細胞活性降低，間接促進了第二型T細胞的活性，致過敏性疾病日增。以往即有研究顯示，得過麻疹、肺結核、A肝的人，較少過敏疾病。由於小寶寶剛出生時，體內以第二型T細胞反應為主，在自然的病毒、細菌刺激減少，又不能不打預防針、故意染病的情況下，使有人提出「細菌療法」的觀念，即攝取益菌，增加第一型T細胞的活性，進而抑制第二型T細胞的作用，以減少過敏發生。

許清祥表示，腸胃道是人體免疫系統最多的地方，所以吃細菌調整免疫力，確實可行。只是，細菌不能亂吃，目前部份乳酸菌已證實可調節免疫機能，服用乳酸菌只能當作過敏的輔助療法，要改善體質、運動、多吃蔬菜水果，哺餵母乳也可以增加體內益菌，才是提升免疫力的治本之道。