根據總統府發布的總統令，馬總統已批准國立故宮博物院院長周功鑫的辭呈，應予免職，生效日期是七月三十日。至於辭職真正的原因，周功鑫昨天堅稱是借調時間期滿，請辭一事從今年五月就開始進行，她說，「在這樣的一個時間裡面，總沒有不散的筵席，階段性任務已經完成，當然就應該是時候了。我說嘛，回故宮要靠勇氣，離開故宮要靠智慧，所以我這是perfect timing。」周功鑫表示想先休息一段時間，可能從輔大退休後擔任講座教授。

周功鑫辭院長職後，確認院長職務由政務副院長周筑昆暫代，周筑昆原擔任行政院公共工程委員會技術處處長，一○○年二月起擔任周功鑫副手，一般認為他是為在大故宮計畫及故宮南院工程部分提供協助，至於正式接任院長的人選應該還是要具備博物館專業背景的人。

但在卸下院長職之後，周功鑫恐怕還得先搬離位於故宮正館後方的院長官舍，昨天故宮公共事務室也證實，周功鑫將於兩個月內搬離位於故宮正館後方的院長官舍，該官舍將改為一般職務宿舍。

其實，原來周功鑫的官舍就是一般職務宿舍，而非故宮院長真正的官舍。原因是周功鑫自六十一年起在故宮服務，六十七年獲配宿舍，直到八十八年自故宮退休後，一家人都還是住在故宮宿舍；九十七年五月，周功鑫回任故宮院長，才被發現，周功鑫一家人在台灣都沒有房地產，卻分別在美國及上海買地置產購豪宅，引發「占故宮宿舍」及「國家認同」的爭議。當時連國民黨立委都覺得社會觀感不好，周功鑫才將原住宿舍申請改為官舍，並放棄永久使用權，載明離開故官院長職務後，須將宿舍歸還故宮。

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