芝山岩600 萬年前，隨今日台灣露出海面後未完全改變，忠實紀錄台北盆地的滄海桑田，是台灣第一個發現史前遺址之地，也是台灣唯一有7個文化層之處。面積約10公頃，海拔最高約 51.8公尺，而芝山文化生態綠園佔全面積的十分之四，也就是 4公頃。

在六千年前，古台北盆地還是一個鹹水湖，當時露出湖面的僅有芝山、圓山、寶藏巖三處較高之小山丘，也就是三座島嶼，其餘地方全被湖水淹沒。後來經長期泥沙淤積，湖水因湖緣切割陸續流失，才慢慢變成沼澤地，進而再現台北盆地的原貌。

芝山岩，是海拔51.8公尺高的小丘陵地，東西長有400公尺，南北最寬處約150公尺這裡有台北市最完善的棧道步道，以保護地表植物及岩層。

芝山岩在六百年前，凱達格蘭族的支系毛紹翁社原住民就到此，過著漁獵游耕的生活，從遺址中出土人工栽培的炭化稻穀，配合大量的農具，可知當時一定有精熟的稻作，大量的鹿、豬、羌、魚的殘骸，可知當時人亦盛行狩獵、漁撈。這個文化在台灣找不出它的源始，學者推測可能來自於浙南閩北地區沿海一帶。

康熙初年，居住在唭哩岸附近的漳州人，和番人達成開發此地區的協議，因此，漳州族群遷居而入住此地。芝山岩原座落在「芝蘭街」，在早期被命名為「芝蘭山」。漳州人落居此地後，為了紀念家鄉漳州的勝地－芝山，而將他更名為「芝山岩」。

經清領時期、日治時期、國民政府時期，先後以保安林和天然紀念物、文化遺跡、或情報局軍事重地等來保護，一律不准開發。所以芝山文化生態綠園的展示?及探坑，保留了豐沛的考古、人文、地質、生態資料，走訪綠園就像開啟一座秘密的寶庫。

芝山文化生態綠園在2005年12月31日，由當時擔任台北市長的馬英九先生主持開幕儀式，從此台北市民多了一個既有文化，又有自然生態的公園。到此一遊一方面可做森林浴，另一方面更可做一次豐盛的文化饗宴，她可使我們體會到老祖先的生活點滴，及台北城市的歷史印記。