政權交接後 , 現在發現沒有交接南線專案的檔案 , 據總統府發言人說 :   檢察官陳瑞仁因國務機要費案起訴吳淑珍等人的起訴書中，早已說明南線專案並不存在，前總統陳水扁相關幕僚，也已承認作偽證，還因此一併遭起訴，當然沒有南線專案檔案 (2008/05/27 聯合晚報)。

我不是法律人 ,. 不知道應該要怎麼辦這案子 , 但是除了貪瀆案子之外 , 陳水扁前總統利用職權  在法院作偽證 , 這是涉及偽證罪 ! 不知道檢察官應不應該起訴陳前總統 ? 如果不起訴 , 是不是代表南線專案存在 ? 那是不是涉及陳水扁前總統竊取總統府機密 ?

現在不管如何 , 陳水扁前總統都已經很明顯的有犯罪跡象了,  特偵組的檢察官在哪裡 ? 你們要如何辦下去 ? 人民都在等著看 !