日本理化學研究所的研究團隊負責人寺尾知可史等人分析了3000多名日本人的基因組（全部遺傳資訊）數據，並發表研究成果稱，日本人的祖先大致與3個血統有關。這項成果可望對修正日本人的祖先來自繩文人和彌生人兩大血統的定論做出貢獻。

除了繩紋人和彌生人以外，日本人的祖先可能還來自其他血統（青森縣的三內丸山遺址還原了繩紋時代的生活）

      研究團隊使用東京大學和理化學研究所運營的日本人遺傳資訊資料庫「日本生物樣本庫（BioBank Japan）」，詳細分析了從北海道及沖繩等日本7個地區收集而來的共計3256人的所有DNA序列。

      結果發現，假設日本人群體是由3個祖先血統混合而成，那麼就能充分解釋各地區的基因序列差異。 3個祖先血統的DNA分別被現代的沖繩人、東北人、關西人相對較多地繼承。

      圍繞著日本人的起源，「雙重結構模型」一直成為定論，這種模型認為日本人由彌生時代從大陸遷移到日本列島的人群和繩紋人混血形成。但最近經過對遺址中發現的人骨的古代DNA進行分析等，出現了「三重結構模型」等觀點，認為古墳時代以後由外國遷移而來的人群也産生了很大影響。

      雖然這次的研究成果「3個祖先血統」並不完全與繩文人及彌生人等一致，但理化學研究所的寺尾知可史指出：「用雙重結構模型很難解釋」。

      這次的研究還獲得了與已經滅絕的人種——尼安德特人（Neanderthals）相關的發現。現代人的祖先被認為與尼安德特人及丹尼索瓦人（Denisovans）進行了雜交。已經新發現40多條被認為是透過雜交遺傳給日本人的基因序列。在繼承自丹尼索瓦人的序列中，有些序列與身高和第2型糖尿病有關。

      這次的研究成果已在4月17日的美國科學期刊《科學進展》（Science Advances）上刊登。