2000年獲得金曲獎最佳作曲人（我等就來唱山歌/交工樂隊）、非流行音樂作品類最佳製作人（鍾永豐、林生祥、陳冠宇）第11屆金曲獎

2002年以交工樂隊獲得金曲獎最佳樂團（菊花夜行軍專輯）第13屆金曲獎

2005年獲得金曲獎最佳客語流行音樂演唱專輯《臨暗》、最佳樂團（生祥與瓦窯坑3）、最佳作詞人（鍾永豐/林生祥）。第16屆金曲獎

2007年依舊以專輯《種樹》獲得金曲獎六項獎項入圍（最佳專輯製作人獎、最佳客語歌手獎、最佳客語專輯、最佳年度歌曲獎、最佳作詞獎、最佳作曲獎），獲得最佳客語歌手獎、最佳客語專輯、最佳作詞人（鍾永豐）。在台上拒領以語言分類的二項獎項，認為音樂獎項應以類型分類、不應以語言分類。金曲獎舉辦以來首次有人拒領獎項，引起社會討論。（相關討論：拒領金曲獎的省思／郭力昕拒領金曲獎，鼓掌/中時電子報網路主筆室，何榮幸）其後並將獎金捐贈給美濃自發性的種樹團隊、月光山雜誌（美濃社區報）、青芽兒雜誌（有機農業雜誌）、楊儒門（白米炸彈客）。（相關紀錄）

2010年專輯《野生》便沒再報名金曲獎以客語分類的獎項，入圍最佳專輯包裝獎（羅文岑、王亮）。同時入圍第10屆華語音樂傳媒大獎。

2010年行政院新聞局創立金音獎，10月發表入圍名單。共入圍【不分類型獎項】的「最佳創作歌手獎」（野生）、「最佳樂手獎」（林生祥/吉他）；【類型音樂獎項】的「最佳民謠專輯獎」（野生）、以及「最佳民謠單曲獎」（南方）。並以專輯《野生》獲得「最佳民謠專輯獎」。 第一屆金音創作獎入圍名單

2011年以專輯《大地書房》入圍第二屆金音獎【不分類型獎項】的「最佳專輯獎」、「最佳創作歌手獎」、「最佳樂手獎」（林生祥/月琴、吉他），以及【類型音樂獎項】的「最佳民謠專輯獎」。最終獲得「最佳專輯獎」、「最佳創作歌手獎」、「最佳民謠專輯獎」三項大獎，為本屆金音獎最大贏家。