成大建築系教授傅朝卿曾說,到台南看古蹟有三大重點:一是荷蘭人治理的遺跡、二是府城遺跡、第三就是基督教文化.屬於基督長老教會的台南神學校,為巴克禮醫師於1876年所創建,不過在1940年太平洋戰爭爆發時,台南神學校被迫關閉,直到1948年才又復校改名為台南神學院,1952年得到美國金陵基金會補助擴建至現在的規模.現有的本館是1903年所建,外觀的尖拱尖塔,採用的是哥德式的建築語彙,現已列為市定古蹟.

禮拜堂的玫瑰窗原本應有瑰麗的彩繪,由於募款不易節約支出,因此沒有上彩繪,但是形式卻是標準的形式.

第一任校長巴克禮牧師(Rev. Dr. Thomas Barclay)

被拆除的原始校舍基座