神户 的前身为大轮田港,此地因六甲山流出的良质水、温和的气候,以及群山、环海,造就出神户优美的环境。 12世纪时,平清盛留意到此地位居交通要街,遂于公元1180年(治承4年)时迁都到「福原」。接着,因对中国宋朝贸易,于是修筑大轮田港,加盖防波堤,这也就是神户港的前身。福原京在短短不到半年的时间内,即一跃成为国际港湾都市,因此在神户的历史中,「平清盛」是个不可或缺的重要人物。
公元1196年,神户东大寺的僧侣「重源」继清盛之后,继续修筑大轮田港,并奠定了港口的基础,迈向一路发展之途。直到室町时代,「兵库」成为与明朝贸易的基地,此为最盛时期。然而树大招风,这儿亦成了兵家必争之地,在室町末期终于引发应仁战火。丧失贸易机能的「兵库」,不得不拱手让出其原有之地位。
到了江户时代,经过逐渐修复兴筑,仅次于大阪。从下关到山阴,成为北陆日本沿海物资集散地,西国街道的宿场町,因而繁荣热闹。那时沿着街道开辟了兵库东边的走水、ニツ茶屋、神户の三村,这些地方都位于现在的元町通附近。当时运输批发及造酒业颇多。
公元1858年,幕府于外国的压力下,缔结了安政五国条约,其中应允对外开放兵库等五港口。但在1862年,惟恐遭受横滨的生麦事件所波及,因而认为近二万人口的兵库不适对外开放,故建筑了新的神户港(现美国码头)和外国人居留地。公元1868年,神户港正式对外开放,从此这个名不见经传的海岸,就成为日本对外的重要门户。
明治维新后,以神户港为中心,开始向外发展,公元1879年,神户村和兵库合并为神户区,并于1888年改为神户市。维新之后的兵库和神户,人口尚不及三万,但在对外开放成商港之后的70年中,人口突破70万。即使在二次大战中受一时的打击影响,但也能迅速复兴,成长为世界性的大港口。
公元1981年,神户成为世界第一个人工海上都市及人工港湾岛,同年并举办港口梨博览会。接着于1989年(平成元年)填平六甲岛,现在正进行的工程是预计于1998年完成的都市全面计划。此外,JR神户的南侧,以「创造连接大海的文化都市」为题,进行开发港口地的工程。在历史中一直脱离不了港口的神户,现在正以开发新水利工程,跃向国际港湾都市。