先免試入學再辦理特色招生，是103年12年國教實施後確定的入學流程，教育部長蔣偉寧5號在立院教育委員會報告時更指出，五月辦理免試時，將同時辦理特色招生的甄選入學，只看術科。
家長團體批評，考生可以同時報考兩個管道，升學壓力根本不會減輕，此外，立法委員也對科學班被納入特色招生的甄選有很大疑慮。科學、藝術和體育只要通過術科考試就能入學，也讓人質疑是否符合五育均衡的精神，至於資優班也不是放在特色招生入學。
由於建中等明星高中在12年國教實施的初期，多達八成五的學生將透過特色招生入學，部長說資優班放在免試入學再來挑選，但要如何從一成五免試的孩子裡挑出資優學生，恐怕又將引起校方反彈。
