司法院大法官會議昨（31）日作出釋字第650號解釋，認為財政部及國稅局只依據行政命令，就對借錢給股東未收取利息或利率太低的公司，設算利息收入課稅，違反憲法第19條租稅法定主義，該規定即日起失效，未確定案件，一律撤銷補稅及罰款處分。
財政部表示，現行僅以營利事業所得稅查核準則等行政命令，規範公司借貸應設算利息收入，法令位階的確太低，將配合降稅措施的所得稅法修正案增訂相關條文，最快在今年底就可提案修法。財政部和國稅局仍認為，這類案件有很多是股東挪用公司資金，應該設算利息收入課稅，較為妥當。
這類被國稅局設算利息課稅的案件很多，光是高等行政法院判決確定的案件就有將近50件，包括知名食品公司羅莎等。營建、化工、傳統產業的母子公司借貸情形最為頻繁，投資公司則是常以「股東往來」的名義，把錢借給股東，都常被課稅。其中爭議最大的是公司資金被股東侵占，東隆五金當年遭大股東掏空，即被國稅局認定是出借資金給侵占者，差點課稅上億元。
這起重大釋憲，由台北市德豐公司的邵姓負責人提出。邵姓業者不滿國稅局逕自依照營利事業所得稅查核準則第36條之1第2項規定，對德豐借貸給玉來建設及德亨建設的兩筆款項，核算利息收入611萬元，被補稅並加處漏稅額一倍罰款，共304萬元，邵姓業者提起行政救濟，但都未獲得平反，因此轉向司法院聲請釋憲，主張該行政命令沒有所得稅法的授權。
儘管借錢給股東未收利息、或收取利息被國稅局認定太低的公司，以公司治理較寬鬆的中小型公司為主，不過，不少被課稅的廠商仍質疑國稅局依行政命令，設算利息收入課稅的作法，並不合理。
大法官會議也認為，雖然設算利息的規定可以防止不肖業者避稅，但沒有法律授權稅捐機關可以自行設算利息，顯然已經逾越所得稅法的規定，增加納稅人的負擔。
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大法官會議認為，雖然所得稅法92年1月在第80條第5項增訂授權財政部訂定查核準則的依據，不過，授權範圍只包括「查核影響所得額、應納稅額與稅額扣抵計算項目」，但仍未賦予稅捐機關自行設算廠商利息收入課稅的權限。
