行政院會通過行政院組織三法，現有三十七部會瘦身為二十九個部會，包括十三部、九會、二總處、一行、一附屬機構及三個獨立機關等。未來將有一半的三級機關（部會下的局、署）被精簡，公務人員總員額可能精簡約七千人。

研考會主委江宜樺強調，這次組織再造「我們是玩真的，我們有信心」。馬總統也指示要在第一個任期內積極推動組織改造。若組織法今年能完成立法，新部會架構將在民國一百年啟動。

江宜樺表示，行政院組織改造工程歷經廿二年，已五次送立院審議，希望這次改組，能讓國家競爭力提升，由瑞士洛桑管理學院評比的第十三名推升至世界前十名以內。

中央三十七部會中，被精簡整併部會有八個，包括新聞局併入文化部、教育部及行政院本部、蒙藏委員會併入陸委會、青輔會併入動勞部與教育部、體委會併入教育部、原能會併入國科會、工程會併入交通及建設部、消保會成為行政院消保處、研考會與經建會合併為國家發展委員會。

行政院會還通過「行政院業務組織及功能暫行條例」、「中央機關組織基準法」草案。明定公務員因組織調整，可於明年六月申請離退，加發七個月慰助金。政府公務人員總額將由現行十八萬二千人，逐年精簡至十七萬五千人。