行政院會通過明年度中央政府總預算案，明年度公共建設預算計列2,151億元，較今年度增加789億元，增幅57.9%，主要是推動各項基礎設施及愛台12建設，其中愛台12建設總經費達1,703億元。

98年度中央政府總預算案，歲入共編列1.7兆元，成長5.2%；歲出編列1.83兆元，增加6.9%。歲出、歲入差短1,248億元，加上650億元債務還本，共需融資調度1,898億元。由於經濟尚未明顯好轉，明年軍公教不調薪。

其中，在國營事業部分，共編列營業總收入3.76兆元，營業總支出為3.78兆元，虧損237億元，主要是台電受國際燃料價格上揚，發電成本持續增加，電價無法十足反應成本上漲，將產生1,496億元虧損；另外健保局保險費率未調整，也編列324億元虧損。

中央政府股息紅利1,823億元，減少91億元，乃因央行受新台幣升值影響，外幣運用收入減少。

愛台12建設中，以全島便捷交通網投入經費最多，為653億元，其次是防洪治水的379億元，智慧台灣242億元，下水道建設130億元，產業創新走廊99億元，高雄自由貿易及生態港70億元。

根據統計，歲入部分，主要是增列所得稅、營業稅及減列貨物稅所致；財產收入，因增列出售台灣菸酒公司預計釋股三成，挹注國庫220億元；台開公司釋股挹注1億餘元，中央再保公司挹注約2億餘元。歲出部分，以教科文支出編列3,430億元，占18.7%居冠；經濟發展支出編列2,652億元，占14.5%居第四。