周末包機開航後，兩岸可望於奧運後就貨運包機、增加包機航班、直航航路等議題進行協商，最快可於10月執行，其中大陸可望依兩會包機會談紀要，再增加六個航點，讓深圳航空、四川航空也飛航兩岸包機，使得經營兩岸航線的航空公司多達13家。

交通部官員表示，交通部早已完成三項空運議題規劃方案，並提報行政院陸委會，只要兩會敲定談判時間，就可展開協商，大陸之前承諾會再開放成都、重慶、杭州、大連、桂林、深圳等六個航點，將會與增加包機航班一併處理。

在貨運包機與直航航路方面，官員強調，這兩項議題會一併討論，因為如果貨運包機不直航，開航貨運包機的意義不大；而直航航路一確定，客、貨運包機都可以走，對航空公司與旅客而言將可節省大量油料與飛航時間。

據了解，我方規劃的直航北航路，走現在的國際航路B576，閃過日本琉球飛航情報區後，西轉進入上海飛航情報區，前往華中、華北的航點，接現在的大陸國內線；南航路則循現在的A1航路到香港後，穿越廣州到華南和西南。

官員表示，新航路劃定後必須向國際民航組織（ICAO）申請，並公告國際，以免其他航線的航機誤闖，作業時間約42天，因此，如果奧運結束後兩岸展開會談，且一切順利的話，最快10月中旬兩岸包機就可走直航航路。

兩岸對新航路已初步交換過意見，還須雙方的航管單位就空域權責、航路設置、航管作業、飛航資料交換，以及航空器失事救助等技術性事項，先行討論。

官員說，兩岸兩會包機會談紀要中限制飛航的班次，但未規定飛航的業者家數，而新增的六個航點中，成都、重慶主要由四川航空經營；深圳為深圳航空的總部，基於照顧地方業者利益，大陸應會開放這兩家航空公司也加入兩岸包機營運行列。

官員指出，不管大陸是否新增航空公司加入兩岸包機飛航，只要市場需求持續增加，目前的18班絕對不敷使用，至於會增加多少班次，雙方會就市場狀況進行協商。