1947年以在東北的滇軍成立，始為東北第一兵團，司令官為孫渡，駐錦州，轄93軍1個軍。1948年1月，與關內的兵團番號統一，改為第六兵團。

1948年6月孫渡調任熱河省主席，盧浚泉繼任兵團司令官。1948年10月錦州周圍的新8軍、93軍、184師共10萬人全部歸第六兵團指揮，但旋即就在遼寧錦州地區被殲滅。 　　

1948年11月，將第九綏靖區司令部改為第六兵團司令部，指揮從東北撤退的39軍、54軍及原屬孫元良兵團的99軍，司令官為李延年。

淮海戰役失敗後，改為負責長江防線，解放軍突破江防南逃，後負責福州地區防禦，兵團轄第25、73、74、96、106軍5個軍十萬餘人。

1949年9月在福建被殲滅。