澎湖縣政府為因應推動與大陸地區實施小三通，促進澎湖觀光的蓬勃發展，特於9月14日在澎縣農漁局長胡流宗的積極運作下，與行政院農委會動植物防疫檢疫局台中分局長黃德昌及澎湖檢疫站主任張俊華連袂拜會縣長王乾發，表達澎湖檢疫前置的籌劃配合，將可有效執行未來小三通的動植物檢疫防疫工作。，

澎湖縣長王乾發表示，離島建設條例第18條明確規定「在台灣本島與大陸地區全面通航之前，得先行試辦金門、馬祖、澎湖地區與大陸地區的通航」，另依台灣地區與大陸地區人民關係條例第95條之1第1項規定「主管機關實施台灣地區與大陸地區直接通商通航前，得現行試辦金門、馬祖、澎湖與大陸地區之通商、通航」；所以，澎湖開辦小三通法律已有明訂，同時澎縣府為突顯實施小三通的必須性，也訂定「澎湖縣推動與大陸地區通航自治條例」並已於9月7日公布施行及報請中央備查中。

王乾發進一步指出，目前己積極籌劃各項事前工作，只期待中央能體恤澎湖人民的需求，儘速同意開辦，同時也感謝分局長黃德昌與澎湖檢疫站主任張俊華對澎湖防檢疫的投入與協力。

另方面，胡流宗也提到分局長黃德昌對於馬祖實施小三通的動植物防檢疫有豐富的實務經驗，未來澎湖若實施與大陸地區的小三通，對於防檢疫的工作將可事竟其功。黃德昌則表示防疫檢疫工作是農委會的職責所在，而澎湖也已成立動植物防疫檢疫站，屆時人員的配比及工作的調配運作，將可配合政策執行所有的相關事宜。

此外，農委會防檢局台中分局澎湖檢疫站已於今年的5月1日成立，對於澎湖地區的犬貓及偶蹄類動物進出，以及對於禽流感、口蹄疫及狂犬病等疫情具有舉足輕重的疫情防範檢查作用，未來實施小三通後將可落實防疫檢查功能。王乾發也強調對於推動小三通的決心毫不氣餒，並再次呼籲中央核准開辦澎湖與大陸地區的通航，以造福澎湖鄉親及促進觀光旅遊的發展。